Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJW3

DNMT3L, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3-like, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT3LQ9UJW3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DNMT3LQ9UJW3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DNMT3LQ9UJW3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DNMT3LQ9UJW3 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DNMT3LQ9UJW3 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DNMT3LQ9UJW3 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DNMT3LQ9UJW3 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DNMT3LQ9UJW3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DNMT3LQ9UJW3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DNMT3LQ9UJW3 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DNMT3LQ9UJW3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DNMT3LQ9UJW3 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
DNMT3LQ9UJW3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DNMT3LQ9UJW3 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DNMT3LQ9UJW3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DNMT3LQ9UJW3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DNMT3LQ9UJW3 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
DNMT3LQ9UJW3 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DNMT3LQ9UJW3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DNMT3LQ9UJW3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DNMT3LQ9UJW3 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
DNMT3LQ9UJW3 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DNMT3LQ9UJW3 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DNMT3LQ9UJW3 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DNMT3LQ9UJW3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DNMT3LQ9UJW3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DNMT3LQ9UJW3 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DNMT3LQ9UJW3 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DNMT3LQ9UJW3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DNMT3LQ9UJW3 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
DNMT3LQ9UJW3 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
DNMT3LQ9UJW3 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DNMT3LQ9UJW3 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DNMT3LQ9UJW3 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
DNMT3LQ9UJW3 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
DNMT3LQ9UJW3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DNMT3LQ9UJW3 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DNMT3LQ9UJW3 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DNMT3LQ9UJW3 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DNMT3LQ9UJW3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DNMT3LQ9UJW3 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DNMT3LQ9UJW3 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DNMT3LQ9UJW3 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DNMT3LQ9UJW3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DNMT3LQ9UJW3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DNMT3LQ9UJW3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DNMT3LQ9UJW3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DNMT3LQ9UJW3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DNMT3LQ9UJW3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DNMT3LQ9UJW3 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DNMT3LQ9UJW3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DNMT3LQ9UJW3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DNMT3LQ9UJW3 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
DNMT3LQ9UJW3 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DNMT3LQ9UJW3 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
DNMT3LQ9UJW3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DNMT3LQ9UJW3 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DNMT3LQ9UJW3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DNMT3LQ9UJW3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DNMT3LQ9UJW3 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DNMT3LQ9UJW3 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DNMT3LQ9UJW3 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DNMT3LQ9UJW3 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DNMT3LQ9UJW3 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DNMT3LQ9UJW3 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DNMT3LQ9UJW3 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
DNMT3LQ9UJW3 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
DNMT3LQ9UJW3 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
DNMT3LQ9UJW3 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
DNMT3LQ9UJW3 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
DNMT3LQ9UJW3 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
DNMT3LQ9UJW3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DNMT3LQ9UJW3 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DNMT3LQ9UJW3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DNMT3LQ9UJW3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DNMT3LQ9UJW3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DNMT3LQ9UJW3 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DNMT3LQ9UJW3 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DNMT3LQ9UJW3 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DNMT3LQ9UJW3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DNMT3LQ9UJW3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DNMT3LQ9UJW3 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
DNMT3LQ9UJW3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DNMT3LQ9UJW3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DNMT3LQ9UJW3 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DNMT3LQ9UJW3 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DNMT3LQ9UJW3 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DNMT3LQ9UJW3 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DNMT3LQ9UJW3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DNMT3LQ9UJW3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
DNMT3LQ9UJW3 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DNMT3LQ9UJW3 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DNMT3LQ9UJW3 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DNMT3LQ9UJW3 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DNMT3LQ9UJW3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DNMT3LQ9UJW3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DNMT3LQ9UJW3 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DNMT3LQ9UJW3 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DNMT3LQ9UJW3 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
DNMT3LQ9UJW3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms