Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW0

VAX2, Ventral anterior homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAX2Q9UIW0 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VAX2Q9UIW0 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VAX2Q9UIW0 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VAX2Q9UIW0 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VAX2Q9UIW0 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VAX2Q9UIW0 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VAX2Q9UIW0 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VAX2Q9UIW0 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VAX2Q9UIW0 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VAX2Q9UIW0 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VAX2Q9UIW0 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VAX2Q9UIW0 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VAX2Q9UIW0 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VAX2Q9UIW0 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VAX2Q9UIW0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VAX2Q9UIW0 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VAX2Q9UIW0 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VAX2Q9UIW0 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VAX2Q9UIW0 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VAX2Q9UIW0 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VAX2Q9UIW0 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VAX2Q9UIW0 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VAX2Q9UIW0 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VAX2Q9UIW0 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VAX2Q9UIW0 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VAX2Q9UIW0 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VAX2Q9UIW0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VAX2Q9UIW0 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VAX2Q9UIW0 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
VAX2Q9UIW0 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VAX2Q9UIW0 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VAX2Q9UIW0 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VAX2Q9UIW0 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VAX2Q9UIW0 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VAX2Q9UIW0 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VAX2Q9UIW0 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VAX2Q9UIW0 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VAX2Q9UIW0 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VAX2Q9UIW0 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VAX2Q9UIW0 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VAX2Q9UIW0 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VAX2Q9UIW0 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VAX2Q9UIW0 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VAX2Q9UIW0 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VAX2Q9UIW0 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VAX2Q9UIW0 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VAX2Q9UIW0 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VAX2Q9UIW0 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VAX2Q9UIW0 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VAX2Q9UIW0 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VAX2Q9UIW0 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VAX2Q9UIW0 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VAX2Q9UIW0 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VAX2Q9UIW0 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VAX2Q9UIW0 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VAX2Q9UIW0 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VAX2Q9UIW0 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VAX2Q9UIW0 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VAX2Q9UIW0 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VAX2Q9UIW0 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VAX2Q9UIW0 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VAX2Q9UIW0 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VAX2Q9UIW0 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VAX2Q9UIW0 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VAX2Q9UIW0 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VAX2Q9UIW0 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VAX2Q9UIW0 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VAX2Q9UIW0 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VAX2Q9UIW0 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VAX2Q9UIW0 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
VAX2Q9UIW0 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VAX2Q9UIW0 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
VAX2Q9UIW0 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
VAX2Q9UIW0 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
VAX2Q9UIW0 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VAX2Q9UIW0 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VAX2Q9UIW0 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
VAX2Q9UIW0 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VAX2Q9UIW0 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VAX2Q9UIW0 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VAX2Q9UIW0 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VAX2Q9UIW0 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VAX2Q9UIW0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VAX2Q9UIW0 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VAX2Q9UIW0 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VAX2Q9UIW0 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VAX2Q9UIW0 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VAX2Q9UIW0 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VAX2Q9UIW0 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
VAX2Q9UIW0 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
VAX2Q9UIW0 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
VAX2Q9UIW0 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VAX2Q9UIW0 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VAX2Q9UIW0 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
VAX2Q9UIW0 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VAX2Q9UIW0 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VAX2Q9UIW0 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VAX2Q9UIW0 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
VAX2Q9UIW0 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
VAX2Q9UIW0 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms