Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH64

CDKN2A-AS1, Susceptibility protein NSG-x, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN2A-AS1Q9UH64 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDKN2A-AS1Q9UH64 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDKN2A-AS1Q9UH64 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDKN2A-AS1Q9UH64 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDKN2A-AS1Q9UH64 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDKN2A-AS1Q9UH64 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDKN2A-AS1Q9UH64 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDKN2A-AS1Q9UH64 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDKN2A-AS1Q9UH64 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDKN2A-AS1Q9UH64 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDKN2A-AS1Q9UH64 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDKN2A-AS1Q9UH64 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDKN2A-AS1Q9UH64 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDKN2A-AS1Q9UH64 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CDKN2A-AS1Q9UH64 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDKN2A-AS1Q9UH64 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDKN2A-AS1Q9UH64 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDKN2A-AS1Q9UH64 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDKN2A-AS1Q9UH64 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDKN2A-AS1Q9UH64 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDKN2A-AS1Q9UH64 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDKN2A-AS1Q9UH64 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDKN2A-AS1Q9UH64 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CDKN2A-AS1Q9UH64 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDKN2A-AS1Q9UH64 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDKN2A-AS1Q9UH64 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDKN2A-AS1Q9UH64 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDKN2A-AS1Q9UH64 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDKN2A-AS1Q9UH64 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDKN2A-AS1Q9UH64 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDKN2A-AS1Q9UH64 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDKN2A-AS1Q9UH64 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDKN2A-AS1Q9UH64 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDKN2A-AS1Q9UH64 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDKN2A-AS1Q9UH64 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDKN2A-AS1Q9UH64 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDKN2A-AS1Q9UH64 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDKN2A-AS1Q9UH64 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDKN2A-AS1Q9UH64 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDKN2A-AS1Q9UH64 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDKN2A-AS1Q9UH64 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDKN2A-AS1Q9UH64 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDKN2A-AS1Q9UH64 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDKN2A-AS1Q9UH64 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDKN2A-AS1Q9UH64 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDKN2A-AS1Q9UH64 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDKN2A-AS1Q9UH64 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDKN2A-AS1Q9UH64 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CDKN2A-AS1Q9UH64 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDKN2A-AS1Q9UH64 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDKN2A-AS1Q9UH64 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDKN2A-AS1Q9UH64 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDKN2A-AS1Q9UH64 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDKN2A-AS1Q9UH64 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDKN2A-AS1Q9UH64 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDKN2A-AS1Q9UH64 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDKN2A-AS1Q9UH64 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDKN2A-AS1Q9UH64 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDKN2A-AS1Q9UH64 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDKN2A-AS1Q9UH64 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDKN2A-AS1Q9UH64 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDKN2A-AS1Q9UH64 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDKN2A-AS1Q9UH64 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDKN2A-AS1Q9UH64 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDKN2A-AS1Q9UH64 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDKN2A-AS1Q9UH64 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDKN2A-AS1Q9UH64 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDKN2A-AS1Q9UH64 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDKN2A-AS1Q9UH64 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDKN2A-AS1Q9UH64 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDKN2A-AS1Q9UH64 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDKN2A-AS1Q9UH64 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDKN2A-AS1Q9UH64 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDKN2A-AS1Q9UH64 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDKN2A-AS1Q9UH64 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDKN2A-AS1Q9UH64 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDKN2A-AS1Q9UH64 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDKN2A-AS1Q9UH64 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDKN2A-AS1Q9UH64 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDKN2A-AS1Q9UH64 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDKN2A-AS1Q9UH64 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDKN2A-AS1Q9UH64 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDKN2A-AS1Q9UH64 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDKN2A-AS1Q9UH64 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDKN2A-AS1Q9UH64 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDKN2A-AS1Q9UH64 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDKN2A-AS1Q9UH64 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDKN2A-AS1Q9UH64 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDKN2A-AS1Q9UH64 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDKN2A-AS1Q9UH64 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDKN2A-AS1Q9UH64 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDKN2A-AS1Q9UH64 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDKN2A-AS1Q9UH64 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDKN2A-AS1Q9UH64 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDKN2A-AS1Q9UH64 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDKN2A-AS1Q9UH64 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDKN2A-AS1Q9UH64 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDKN2A-AS1Q9UH64 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDKN2A-AS1Q9UH64 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDKN2A-AS1Q9UH64 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms