Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGU5

HMGXB4, HMG domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGXB4Q9UGU5 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HMGXB4Q9UGU5 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HMGXB4Q9UGU5 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HMGXB4Q9UGU5 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HMGXB4Q9UGU5 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HMGXB4Q9UGU5 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HMGXB4Q9UGU5 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HMGXB4Q9UGU5 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HMGXB4Q9UGU5 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HMGXB4Q9UGU5 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HMGXB4Q9UGU5 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HMGXB4Q9UGU5 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HMGXB4Q9UGU5 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HMGXB4Q9UGU5 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HMGXB4Q9UGU5 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HMGXB4Q9UGU5 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HMGXB4Q9UGU5 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HMGXB4Q9UGU5 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HMGXB4Q9UGU5 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HMGXB4Q9UGU5 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HMGXB4Q9UGU5 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HMGXB4Q9UGU5 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HMGXB4Q9UGU5 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HMGXB4Q9UGU5 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HMGXB4Q9UGU5 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HMGXB4Q9UGU5 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HMGXB4Q9UGU5 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HMGXB4Q9UGU5 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HMGXB4Q9UGU5 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HMGXB4Q9UGU5 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HMGXB4Q9UGU5 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HMGXB4Q9UGU5 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
HMGXB4Q9UGU5 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HMGXB4Q9UGU5 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HMGXB4Q9UGU5 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HMGXB4Q9UGU5 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
HMGXB4Q9UGU5 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
HMGXB4Q9UGU5 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HMGXB4Q9UGU5 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HMGXB4Q9UGU5 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HMGXB4Q9UGU5 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HMGXB4Q9UGU5 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HMGXB4Q9UGU5 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HMGXB4Q9UGU5 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HMGXB4Q9UGU5 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HMGXB4Q9UGU5 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HMGXB4Q9UGU5 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HMGXB4Q9UGU5 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HMGXB4Q9UGU5 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HMGXB4Q9UGU5 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HMGXB4Q9UGU5 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HMGXB4Q9UGU5 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HMGXB4Q9UGU5 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HMGXB4Q9UGU5 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HMGXB4Q9UGU5 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HMGXB4Q9UGU5 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HMGXB4Q9UGU5 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HMGXB4Q9UGU5 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HMGXB4Q9UGU5 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HMGXB4Q9UGU5 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HMGXB4Q9UGU5 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HMGXB4Q9UGU5 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HMGXB4Q9UGU5 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HMGXB4Q9UGU5 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HMGXB4Q9UGU5 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HMGXB4Q9UGU5 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HMGXB4Q9UGU5 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HMGXB4Q9UGU5 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HMGXB4Q9UGU5 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HMGXB4Q9UGU5 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HMGXB4Q9UGU5 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HMGXB4Q9UGU5 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HMGXB4Q9UGU5 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HMGXB4Q9UGU5 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HMGXB4Q9UGU5 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HMGXB4Q9UGU5 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HMGXB4Q9UGU5 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HMGXB4Q9UGU5 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
HMGXB4Q9UGU5 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
HMGXB4Q9UGU5 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
HMGXB4Q9UGU5 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HMGXB4Q9UGU5 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HMGXB4Q9UGU5 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
HMGXB4Q9UGU5 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HMGXB4Q9UGU5 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
HMGXB4Q9UGU5 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HMGXB4Q9UGU5 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HMGXB4Q9UGU5 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HMGXB4Q9UGU5 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HMGXB4Q9UGU5 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HMGXB4Q9UGU5 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HMGXB4Q9UGU5 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HMGXB4Q9UGU5 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HMGXB4Q9UGU5 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HMGXB4Q9UGU5 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HMGXB4Q9UGU5 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HMGXB4Q9UGU5 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HMGXB4Q9UGU5 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HMGXB4Q9UGU5 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HMGXB4Q9UGU5 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms