Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGI6

KCNN3, Small conductance calcium-activated potassium channel protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNN3Q9UGI6 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNN3Q9UGI6 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNN3Q9UGI6 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNN3Q9UGI6 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNN3Q9UGI6 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNN3Q9UGI6 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNN3Q9UGI6 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNN3Q9UGI6 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNN3Q9UGI6 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNN3Q9UGI6 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNN3Q9UGI6 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNN3Q9UGI6 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNN3Q9UGI6 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNN3Q9UGI6 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNN3Q9UGI6 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNN3Q9UGI6 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNN3Q9UGI6 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNN3Q9UGI6 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNN3Q9UGI6 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNN3Q9UGI6 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNN3Q9UGI6 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNN3Q9UGI6 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNN3Q9UGI6 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNN3Q9UGI6 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNN3Q9UGI6 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNN3Q9UGI6 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNN3Q9UGI6 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNN3Q9UGI6 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNN3Q9UGI6 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNN3Q9UGI6 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNN3Q9UGI6 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNN3Q9UGI6 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNN3Q9UGI6 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNN3Q9UGI6 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNN3Q9UGI6 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNN3Q9UGI6 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNN3Q9UGI6 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNN3Q9UGI6 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNN3Q9UGI6 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNN3Q9UGI6 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNN3Q9UGI6 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
KCNN3Q9UGI6 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KCNN3Q9UGI6 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KCNN3Q9UGI6 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KCNN3Q9UGI6 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KCNN3Q9UGI6 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KCNN3Q9UGI6 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KCNN3Q9UGI6 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KCNN3Q9UGI6 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KCNN3Q9UGI6 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KCNN3Q9UGI6 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KCNN3Q9UGI6 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
KCNN3Q9UGI6 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KCNN3Q9UGI6 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KCNN3Q9UGI6 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KCNN3Q9UGI6 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KCNN3Q9UGI6 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KCNN3Q9UGI6 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KCNN3Q9UGI6 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KCNN3Q9UGI6 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KCNN3Q9UGI6 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
KCNN3Q9UGI6 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KCNN3Q9UGI6 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KCNN3Q9UGI6 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KCNN3Q9UGI6 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
KCNN3Q9UGI6 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KCNN3Q9UGI6 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KCNN3Q9UGI6 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KCNN3Q9UGI6 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KCNN3Q9UGI6 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KCNN3Q9UGI6 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KCNN3Q9UGI6 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KCNN3Q9UGI6 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KCNN3Q9UGI6 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KCNN3Q9UGI6 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
KCNN3Q9UGI6 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KCNN3Q9UGI6 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KCNN3Q9UGI6 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KCNN3Q9UGI6 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KCNN3Q9UGI6 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KCNN3Q9UGI6 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KCNN3Q9UGI6 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KCNN3Q9UGI6 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KCNN3Q9UGI6 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KCNN3Q9UGI6 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KCNN3Q9UGI6 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
KCNN3Q9UGI6 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KCNN3Q9UGI6 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KCNN3Q9UGI6 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KCNN3Q9UGI6 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KCNN3Q9UGI6 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KCNN3Q9UGI6 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KCNN3Q9UGI6 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
KCNN3Q9UGI6 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
KCNN3Q9UGI6 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KCNN3Q9UGI6 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KCNN3Q9UGI6 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KCNN3Q9UGI6 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KCNN3Q9UGI6 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KCNN3Q9UGI6 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1120.4 ms