Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBY8

CLN8, Protein CLN8, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8Q9UBY8 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CLN8Q9UBY8 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CLN8Q9UBY8 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CLN8Q9UBY8 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CLN8Q9UBY8 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CLN8Q9UBY8 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CLN8Q9UBY8 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CLN8Q9UBY8 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CLN8Q9UBY8 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CLN8Q9UBY8 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CLN8Q9UBY8 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CLN8Q9UBY8 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLN8Q9UBY8 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLN8Q9UBY8 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CLN8Q9UBY8 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLN8Q9UBY8 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLN8Q9UBY8 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLN8Q9UBY8 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLN8Q9UBY8 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CLN8Q9UBY8 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLN8Q9UBY8 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLN8Q9UBY8 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLN8Q9UBY8 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CLN8Q9UBY8 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CLN8Q9UBY8 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CLN8Q9UBY8 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CLN8Q9UBY8 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CLN8Q9UBY8 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CLN8Q9UBY8 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CLN8Q9UBY8 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CLN8Q9UBY8 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CLN8Q9UBY8 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CLN8Q9UBY8 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CLN8Q9UBY8 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CLN8Q9UBY8 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CLN8Q9UBY8 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CLN8Q9UBY8 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CLN8Q9UBY8 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CLN8Q9UBY8 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CLN8Q9UBY8 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CLN8Q9UBY8 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CLN8Q9UBY8 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CLN8Q9UBY8 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CLN8Q9UBY8 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CLN8Q9UBY8 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CLN8Q9UBY8 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CLN8Q9UBY8 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CLN8Q9UBY8 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CLN8Q9UBY8 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CLN8Q9UBY8 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CLN8Q9UBY8 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CLN8Q9UBY8 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CLN8Q9UBY8 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CLN8Q9UBY8 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CLN8Q9UBY8 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CLN8Q9UBY8 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CLN8Q9UBY8 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CLN8Q9UBY8 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CLN8Q9UBY8 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CLN8Q9UBY8 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CLN8Q9UBY8 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CLN8Q9UBY8 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CLN8Q9UBY8 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CLN8Q9UBY8 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CLN8Q9UBY8 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CLN8Q9UBY8 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CLN8Q9UBY8 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CLN8Q9UBY8 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CLN8Q9UBY8 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CLN8Q9UBY8 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CLN8Q9UBY8 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CLN8Q9UBY8 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CLN8Q9UBY8 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLN8Q9UBY8 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLN8Q9UBY8 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLN8Q9UBY8 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLN8Q9UBY8 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLN8Q9UBY8 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLN8Q9UBY8 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLN8Q9UBY8 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLN8Q9UBY8 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLN8Q9UBY8 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLN8Q9UBY8 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLN8Q9UBY8 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLN8Q9UBY8 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLN8Q9UBY8 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLN8Q9UBY8 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLN8Q9UBY8 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLN8Q9UBY8 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLN8Q9UBY8 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLN8Q9UBY8 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLN8Q9UBY8 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLN8Q9UBY8 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLN8Q9UBY8 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CLN8Q9UBY8 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CLN8Q9UBY8 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CLN8Q9UBY8 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CLN8Q9UBY8 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CLN8Q9UBY8 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CLN8Q9UBY8 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms