Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK8

MTRR, Methionine synthase reductase, humanhuman

Predictions only

Length 725 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTRRQ9UBK8 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
MTRRQ9UBK8 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MTRRQ9UBK8 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MTRRQ9UBK8 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MTRRQ9UBK8 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MTRRQ9UBK8 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MTRRQ9UBK8 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MTRRQ9UBK8 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MTRRQ9UBK8 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MTRRQ9UBK8 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MTRRQ9UBK8 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MTRRQ9UBK8 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MTRRQ9UBK8 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MTRRQ9UBK8 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MTRRQ9UBK8 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MTRRQ9UBK8 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MTRRQ9UBK8 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MTRRQ9UBK8 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MTRRQ9UBK8 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
MTRRQ9UBK8 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
MTRRQ9UBK8 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MTRRQ9UBK8 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MTRRQ9UBK8 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MTRRQ9UBK8 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MTRRQ9UBK8 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MTRRQ9UBK8 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MTRRQ9UBK8 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MTRRQ9UBK8 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MTRRQ9UBK8 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MTRRQ9UBK8 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MTRRQ9UBK8 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MTRRQ9UBK8 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MTRRQ9UBK8 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MTRRQ9UBK8 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
MTRRQ9UBK8 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MTRRQ9UBK8 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MTRRQ9UBK8 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MTRRQ9UBK8 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MTRRQ9UBK8 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
MTRRQ9UBK8 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MTRRQ9UBK8 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
MTRRQ9UBK8 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MTRRQ9UBK8 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MTRRQ9UBK8 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MTRRQ9UBK8 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MTRRQ9UBK8 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MTRRQ9UBK8 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
MTRRQ9UBK8 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MTRRQ9UBK8 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MTRRQ9UBK8 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MTRRQ9UBK8 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
MTRRQ9UBK8 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MTRRQ9UBK8 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MTRRQ9UBK8 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MTRRQ9UBK8 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MTRRQ9UBK8 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MTRRQ9UBK8 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
MTRRQ9UBK8 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MTRRQ9UBK8 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MTRRQ9UBK8 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MTRRQ9UBK8 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MTRRQ9UBK8 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MTRRQ9UBK8 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MTRRQ9UBK8 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MTRRQ9UBK8 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MTRRQ9UBK8 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MTRRQ9UBK8 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MTRRQ9UBK8 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MTRRQ9UBK8 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MTRRQ9UBK8 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MTRRQ9UBK8 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MTRRQ9UBK8 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
MTRRQ9UBK8 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MTRRQ9UBK8 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MTRRQ9UBK8 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MTRRQ9UBK8 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MTRRQ9UBK8 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MTRRQ9UBK8 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MTRRQ9UBK8 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MTRRQ9UBK8 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MTRRQ9UBK8 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MTRRQ9UBK8 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MTRRQ9UBK8 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MTRRQ9UBK8 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MTRRQ9UBK8 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MTRRQ9UBK8 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MTRRQ9UBK8 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MTRRQ9UBK8 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MTRRQ9UBK8 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MTRRQ9UBK8 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MTRRQ9UBK8 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
MTRRQ9UBK8 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MTRRQ9UBK8 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MTRRQ9UBK8 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MTRRQ9UBK8 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
MTRRQ9UBK8 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MTRRQ9UBK8 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MTRRQ9UBK8 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MTRRQ9UBK8 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MTRRQ9UBK8 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms