Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHL42Q9P2K6 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHL42Q9P2K6 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHL42Q9P2K6 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHL42Q9P2K6 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHL42Q9P2K6 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHL42Q9P2K6 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHL42Q9P2K6 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHL42Q9P2K6 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHL42Q9P2K6 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHL42Q9P2K6 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHL42Q9P2K6 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHL42Q9P2K6 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHL42Q9P2K6 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHL42Q9P2K6 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHL42Q9P2K6 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHL42Q9P2K6 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHL42Q9P2K6 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHL42Q9P2K6 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHL42Q9P2K6 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHL42Q9P2K6 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHL42Q9P2K6 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHL42Q9P2K6 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHL42Q9P2K6 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHL42Q9P2K6 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHL42Q9P2K6 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHL42Q9P2K6 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHL42Q9P2K6 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHL42Q9P2K6 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHL42Q9P2K6 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.15
KLHL42Q9P2K6 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHL42Q9P2K6 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHL42Q9P2K6 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHL42Q9P2K6 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHL42Q9P2K6 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHL42Q9P2K6 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHL42Q9P2K6 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHL42Q9P2K6 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL42Q9P2K6 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL42Q9P2K6 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL42Q9P2K6 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL42Q9P2K6 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL42Q9P2K6 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL42Q9P2K6 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL42Q9P2K6 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL42Q9P2K6 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL42Q9P2K6 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL42Q9P2K6 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL42Q9P2K6 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL42Q9P2K6 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL42Q9P2K6 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL42Q9P2K6 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL42Q9P2K6 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL42Q9P2K6 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL42Q9P2K6 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL42Q9P2K6 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL42Q9P2K6 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL42Q9P2K6 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL42Q9P2K6 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL42Q9P2K6 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL42Q9P2K6 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL42Q9P2K6 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL42Q9P2K6 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL42Q9P2K6 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL42Q9P2K6 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL42Q9P2K6 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL42Q9P2K6 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL42Q9P2K6 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL42Q9P2K6 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL42Q9P2K6 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL42Q9P2K6 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL42Q9P2K6 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL42Q9P2K6 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHL42Q9P2K6 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHL42Q9P2K6 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHL42Q9P2K6 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHL42Q9P2K6 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHL42Q9P2K6 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHL42Q9P2K6 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHL42Q9P2K6 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHL42Q9P2K6 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHL42Q9P2K6 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL42Q9P2K6 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL42Q9P2K6 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL42Q9P2K6 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL42Q9P2K6 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL42Q9P2K6 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL42Q9P2K6 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL42Q9P2K6 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL42Q9P2K6 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL42Q9P2K6 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KLHL42Q9P2K6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KLHL42Q9P2K6 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
KLHL42Q9P2K6 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
KLHL42Q9P2K6 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLHL42Q9P2K6 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLHL42Q9P2K6 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLHL42Q9P2K6 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLHL42Q9P2K6 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLHL42Q9P2K6 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms