Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZG7

NINJ2, Ninjurin-2, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NINJ2Q9NZG7 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NINJ2Q9NZG7 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NINJ2Q9NZG7 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NINJ2Q9NZG7 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NINJ2Q9NZG7 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NINJ2Q9NZG7 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NINJ2Q9NZG7 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NINJ2Q9NZG7 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NINJ2Q9NZG7 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NINJ2Q9NZG7 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NINJ2Q9NZG7 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NINJ2Q9NZG7 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NINJ2Q9NZG7 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NINJ2Q9NZG7 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NINJ2Q9NZG7 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NINJ2Q9NZG7 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NINJ2Q9NZG7 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NINJ2Q9NZG7 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NINJ2Q9NZG7 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NINJ2Q9NZG7 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NINJ2Q9NZG7 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NINJ2Q9NZG7 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NINJ2Q9NZG7 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NINJ2Q9NZG7 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NINJ2Q9NZG7 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NINJ2Q9NZG7 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NINJ2Q9NZG7 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NINJ2Q9NZG7 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NINJ2Q9NZG7 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NINJ2Q9NZG7 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NINJ2Q9NZG7 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NINJ2Q9NZG7 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NINJ2Q9NZG7 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NINJ2Q9NZG7 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NINJ2Q9NZG7 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NINJ2Q9NZG7 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NINJ2Q9NZG7 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NINJ2Q9NZG7 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NINJ2Q9NZG7 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NINJ2Q9NZG7 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NINJ2Q9NZG7 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NINJ2Q9NZG7 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NINJ2Q9NZG7 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NINJ2Q9NZG7 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NINJ2Q9NZG7 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NINJ2Q9NZG7 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NINJ2Q9NZG7 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NINJ2Q9NZG7 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NINJ2Q9NZG7 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NINJ2Q9NZG7 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NINJ2Q9NZG7 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NINJ2Q9NZG7 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NINJ2Q9NZG7 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NINJ2Q9NZG7 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NINJ2Q9NZG7 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NINJ2Q9NZG7 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NINJ2Q9NZG7 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NINJ2Q9NZG7 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NINJ2Q9NZG7 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NINJ2Q9NZG7 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NINJ2Q9NZG7 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NINJ2Q9NZG7 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NINJ2Q9NZG7 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NINJ2Q9NZG7 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NINJ2Q9NZG7 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NINJ2Q9NZG7 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NINJ2Q9NZG7 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
NINJ2Q9NZG7 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NINJ2Q9NZG7 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NINJ2Q9NZG7 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NINJ2Q9NZG7 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NINJ2Q9NZG7 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NINJ2Q9NZG7 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NINJ2Q9NZG7 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NINJ2Q9NZG7 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NINJ2Q9NZG7 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NINJ2Q9NZG7 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NINJ2Q9NZG7 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NINJ2Q9NZG7 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NINJ2Q9NZG7 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NINJ2Q9NZG7 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NINJ2Q9NZG7 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NINJ2Q9NZG7 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NINJ2Q9NZG7 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NINJ2Q9NZG7 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NINJ2Q9NZG7 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NINJ2Q9NZG7 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NINJ2Q9NZG7 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NINJ2Q9NZG7 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NINJ2Q9NZG7 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NINJ2Q9NZG7 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NINJ2Q9NZG7 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NINJ2Q9NZG7 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NINJ2Q9NZG7 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NINJ2Q9NZG7 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NINJ2Q9NZG7 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NINJ2Q9NZG7 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NINJ2Q9NZG7 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NINJ2Q9NZG7 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NINJ2Q9NZG7 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms