Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYI0

PSD3, PH and SEC7 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSD3Q9NYI0 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSD3Q9NYI0 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSD3Q9NYI0 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSD3Q9NYI0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PSD3Q9NYI0 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PSD3Q9NYI0 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSD3Q9NYI0 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSD3Q9NYI0 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSD3Q9NYI0 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSD3Q9NYI0 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSD3Q9NYI0 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSD3Q9NYI0 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSD3Q9NYI0 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSD3Q9NYI0 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSD3Q9NYI0 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSD3Q9NYI0 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSD3Q9NYI0 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSD3Q9NYI0 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSD3Q9NYI0 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PSD3Q9NYI0 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSD3Q9NYI0 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSD3Q9NYI0 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSD3Q9NYI0 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSD3Q9NYI0 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PSD3Q9NYI0 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PSD3Q9NYI0 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PSD3Q9NYI0 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PSD3Q9NYI0 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PSD3Q9NYI0 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PSD3Q9NYI0 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PSD3Q9NYI0 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PSD3Q9NYI0 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PSD3Q9NYI0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PSD3Q9NYI0 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PSD3Q9NYI0 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PSD3Q9NYI0 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PSD3Q9NYI0 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PSD3Q9NYI0 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PSD3Q9NYI0 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSD3Q9NYI0 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSD3Q9NYI0 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSD3Q9NYI0 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSD3Q9NYI0 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSD3Q9NYI0 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSD3Q9NYI0 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSD3Q9NYI0 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSD3Q9NYI0 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSD3Q9NYI0 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSD3Q9NYI0 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSD3Q9NYI0 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSD3Q9NYI0 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSD3Q9NYI0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSD3Q9NYI0 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSD3Q9NYI0 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSD3Q9NYI0 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSD3Q9NYI0 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PSD3Q9NYI0 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PSD3Q9NYI0 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PSD3Q9NYI0 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PSD3Q9NYI0 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PSD3Q9NYI0 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PSD3Q9NYI0 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PSD3Q9NYI0 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PSD3Q9NYI0 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PSD3Q9NYI0 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PSD3Q9NYI0 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PSD3Q9NYI0 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PSD3Q9NYI0 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PSD3Q9NYI0 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PSD3Q9NYI0 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PSD3Q9NYI0 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PSD3Q9NYI0 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PSD3Q9NYI0 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PSD3Q9NYI0 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PSD3Q9NYI0 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PSD3Q9NYI0 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PSD3Q9NYI0 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PSD3Q9NYI0 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PSD3Q9NYI0 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PSD3Q9NYI0 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PSD3Q9NYI0 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PSD3Q9NYI0 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PSD3Q9NYI0 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PSD3Q9NYI0 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PSD3Q9NYI0 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PSD3Q9NYI0 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PSD3Q9NYI0 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PSD3Q9NYI0 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PSD3Q9NYI0 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PSD3Q9NYI0 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PSD3Q9NYI0 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PSD3Q9NYI0 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PSD3Q9NYI0 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PSD3Q9NYI0 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PSD3Q9NYI0 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PSD3Q9NYI0 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PSD3Q9NYI0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PSD3Q9NYI0 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PSD3Q9NYI0 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PSD3Q9NYI0 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.4 ms