Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXS3

KLHL28, Kelch-like protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL28Q9NXS3 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL28Q9NXS3 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL28Q9NXS3 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL28Q9NXS3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
KLHL28Q9NXS3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KLHL28Q9NXS3 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KLHL28Q9NXS3 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KLHL28Q9NXS3 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KLHL28Q9NXS3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KLHL28Q9NXS3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KLHL28Q9NXS3 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KLHL28Q9NXS3 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KLHL28Q9NXS3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
KLHL28Q9NXS3 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
KLHL28Q9NXS3 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
KLHL28Q9NXS3 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHL28Q9NXS3 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHL28Q9NXS3 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHL28Q9NXS3 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHL28Q9NXS3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHL28Q9NXS3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHL28Q9NXS3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHL28Q9NXS3 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHL28Q9NXS3 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHL28Q9NXS3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHL28Q9NXS3 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHL28Q9NXS3 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHL28Q9NXS3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHL28Q9NXS3 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHL28Q9NXS3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHL28Q9NXS3 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHL28Q9NXS3 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHL28Q9NXS3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHL28Q9NXS3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHL28Q9NXS3 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHL28Q9NXS3 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHL28Q9NXS3 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHL28Q9NXS3 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHL28Q9NXS3 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLHL28Q9NXS3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLHL28Q9NXS3 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLHL28Q9NXS3 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
KLHL28Q9NXS3 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLHL28Q9NXS3 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLHL28Q9NXS3 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLHL28Q9NXS3 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLHL28Q9NXS3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLHL28Q9NXS3 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLHL28Q9NXS3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLHL28Q9NXS3 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL28Q9NXS3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL28Q9NXS3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL28Q9NXS3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL28Q9NXS3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL28Q9NXS3 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL28Q9NXS3 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL28Q9NXS3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL28Q9NXS3 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL28Q9NXS3 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL28Q9NXS3 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL28Q9NXS3 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL28Q9NXS3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL28Q9NXS3 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL28Q9NXS3 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL28Q9NXS3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL28Q9NXS3 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL28Q9NXS3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL28Q9NXS3 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL28Q9NXS3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL28Q9NXS3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL28Q9NXS3 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL28Q9NXS3 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL28Q9NXS3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL28Q9NXS3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL28Q9NXS3 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL28Q9NXS3 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL28Q9NXS3 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL28Q9NXS3 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL28Q9NXS3 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL28Q9NXS3 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL28Q9NXS3 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLHL28Q9NXS3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLHL28Q9NXS3 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLHL28Q9NXS3 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
KLHL28Q9NXS3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLHL28Q9NXS3 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
KLHL28Q9NXS3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLHL28Q9NXS3 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
KLHL28Q9NXS3 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLHL28Q9NXS3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLHL28Q9NXS3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLHL28Q9NXS3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLHL28Q9NXS3 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLHL28Q9NXS3 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLHL28Q9NXS3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLHL28Q9NXS3 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLHL28Q9NXS3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLHL28Q9NXS3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLHL28Q9NXS3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
KLHL28Q9NXS3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms