Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVX2

NLE1, Notchless protein homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLE1Q9NVX2 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NLE1Q9NVX2 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NLE1Q9NVX2 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NLE1Q9NVX2 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NLE1Q9NVX2 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NLE1Q9NVX2 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NLE1Q9NVX2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NLE1Q9NVX2 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NLE1Q9NVX2 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NLE1Q9NVX2 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NLE1Q9NVX2 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NLE1Q9NVX2 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NLE1Q9NVX2 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
NLE1Q9NVX2 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
NLE1Q9NVX2 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NLE1Q9NVX2 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NLE1Q9NVX2 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NLE1Q9NVX2 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NLE1Q9NVX2 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NLE1Q9NVX2 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NLE1Q9NVX2 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NLE1Q9NVX2 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NLE1Q9NVX2 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
NLE1Q9NVX2 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NLE1Q9NVX2 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NLE1Q9NVX2 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NLE1Q9NVX2 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NLE1Q9NVX2 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NLE1Q9NVX2 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
NLE1Q9NVX2 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NLE1Q9NVX2 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NLE1Q9NVX2 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NLE1Q9NVX2 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NLE1Q9NVX2 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NLE1Q9NVX2 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NLE1Q9NVX2 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NLE1Q9NVX2 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NLE1Q9NVX2 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NLE1Q9NVX2 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NLE1Q9NVX2 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NLE1Q9NVX2 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NLE1Q9NVX2 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NLE1Q9NVX2 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NLE1Q9NVX2 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NLE1Q9NVX2 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NLE1Q9NVX2 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NLE1Q9NVX2 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NLE1Q9NVX2 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NLE1Q9NVX2 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NLE1Q9NVX2 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NLE1Q9NVX2 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NLE1Q9NVX2 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NLE1Q9NVX2 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NLE1Q9NVX2 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NLE1Q9NVX2 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NLE1Q9NVX2 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NLE1Q9NVX2 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NLE1Q9NVX2 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NLE1Q9NVX2 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NLE1Q9NVX2 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NLE1Q9NVX2 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NLE1Q9NVX2 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NLE1Q9NVX2 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NLE1Q9NVX2 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NLE1Q9NVX2 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NLE1Q9NVX2 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NLE1Q9NVX2 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NLE1Q9NVX2 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NLE1Q9NVX2 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NLE1Q9NVX2 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NLE1Q9NVX2 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NLE1Q9NVX2 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NLE1Q9NVX2 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NLE1Q9NVX2 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NLE1Q9NVX2 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NLE1Q9NVX2 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NLE1Q9NVX2 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NLE1Q9NVX2 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NLE1Q9NVX2 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NLE1Q9NVX2 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NLE1Q9NVX2 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NLE1Q9NVX2 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NLE1Q9NVX2 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NLE1Q9NVX2 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NLE1Q9NVX2 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NLE1Q9NVX2 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NLE1Q9NVX2 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NLE1Q9NVX2 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NLE1Q9NVX2 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NLE1Q9NVX2 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NLE1Q9NVX2 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NLE1Q9NVX2 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NLE1Q9NVX2 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NLE1Q9NVX2 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NLE1Q9NVX2 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NLE1Q9NVX2 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NLE1Q9NVX2 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NLE1Q9NVX2 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NLE1Q9NVX2 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NLE1Q9NVX2 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms