Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN5

LMBRD1, Probable lysosomal cobalamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD1Q9NUN5 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LMBRD1Q9NUN5 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LMBRD1Q9NUN5 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LMBRD1Q9NUN5 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LMBRD1Q9NUN5 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LMBRD1Q9NUN5 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LMBRD1Q9NUN5 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LMBRD1Q9NUN5 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LMBRD1Q9NUN5 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LMBRD1Q9NUN5 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LMBRD1Q9NUN5 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LMBRD1Q9NUN5 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LMBRD1Q9NUN5 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LMBRD1Q9NUN5 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LMBRD1Q9NUN5 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LMBRD1Q9NUN5 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LMBRD1Q9NUN5 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LMBRD1Q9NUN5 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LMBRD1Q9NUN5 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LMBRD1Q9NUN5 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LMBRD1Q9NUN5 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LMBRD1Q9NUN5 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LMBRD1Q9NUN5 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LMBRD1Q9NUN5 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LMBRD1Q9NUN5 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LMBRD1Q9NUN5 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
LMBRD1Q9NUN5 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
LMBRD1Q9NUN5 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
LMBRD1Q9NUN5 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LMBRD1Q9NUN5 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
LMBRD1Q9NUN5 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LMBRD1Q9NUN5 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
LMBRD1Q9NUN5 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
LMBRD1Q9NUN5 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
LMBRD1Q9NUN5 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
LMBRD1Q9NUN5 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
LMBRD1Q9NUN5 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LMBRD1Q9NUN5 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LMBRD1Q9NUN5 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LMBRD1Q9NUN5 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LMBRD1Q9NUN5 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LMBRD1Q9NUN5 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LMBRD1Q9NUN5 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LMBRD1Q9NUN5 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LMBRD1Q9NUN5 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LMBRD1Q9NUN5 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LMBRD1Q9NUN5 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LMBRD1Q9NUN5 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LMBRD1Q9NUN5 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LMBRD1Q9NUN5 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LMBRD1Q9NUN5 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LMBRD1Q9NUN5 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LMBRD1Q9NUN5 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
LMBRD1Q9NUN5 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LMBRD1Q9NUN5 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LMBRD1Q9NUN5 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LMBRD1Q9NUN5 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LMBRD1Q9NUN5 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LMBRD1Q9NUN5 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LMBRD1Q9NUN5 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LMBRD1Q9NUN5 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LMBRD1Q9NUN5 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LMBRD1Q9NUN5 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LMBRD1Q9NUN5 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LMBRD1Q9NUN5 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LMBRD1Q9NUN5 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LMBRD1Q9NUN5 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LMBRD1Q9NUN5 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LMBRD1Q9NUN5 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LMBRD1Q9NUN5 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LMBRD1Q9NUN5 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LMBRD1Q9NUN5 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LMBRD1Q9NUN5 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LMBRD1Q9NUN5 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LMBRD1Q9NUN5 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LMBRD1Q9NUN5 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LMBRD1Q9NUN5 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
LMBRD1Q9NUN5 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
LMBRD1Q9NUN5 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LMBRD1Q9NUN5 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LMBRD1Q9NUN5 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LMBRD1Q9NUN5 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LMBRD1Q9NUN5 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LMBRD1Q9NUN5 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LMBRD1Q9NUN5 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
LMBRD1Q9NUN5 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LMBRD1Q9NUN5 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LMBRD1Q9NUN5 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LMBRD1Q9NUN5 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LMBRD1Q9NUN5 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LMBRD1Q9NUN5 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LMBRD1Q9NUN5 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LMBRD1Q9NUN5 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LMBRD1Q9NUN5 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LMBRD1Q9NUN5 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LMBRD1Q9NUN5 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LMBRD1Q9NUN5 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LMBRD1Q9NUN5 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LMBRD1Q9NUN5 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LMBRD1Q9NUN5 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms