Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTX5

ECHDC1, Ethylmalonyl-CoA decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC1Q9NTX5 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ECHDC1Q9NTX5 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ECHDC1Q9NTX5 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ECHDC1Q9NTX5 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ECHDC1Q9NTX5 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ECHDC1Q9NTX5 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ECHDC1Q9NTX5 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ECHDC1Q9NTX5 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ECHDC1Q9NTX5 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ECHDC1Q9NTX5 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ECHDC1Q9NTX5 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ECHDC1Q9NTX5 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ECHDC1Q9NTX5 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ECHDC1Q9NTX5 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ECHDC1Q9NTX5 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ECHDC1Q9NTX5 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ECHDC1Q9NTX5 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ECHDC1Q9NTX5 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ECHDC1Q9NTX5 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ECHDC1Q9NTX5 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ECHDC1Q9NTX5 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ECHDC1Q9NTX5 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ECHDC1Q9NTX5 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ECHDC1Q9NTX5 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ECHDC1Q9NTX5 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ECHDC1Q9NTX5 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ECHDC1Q9NTX5 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ECHDC1Q9NTX5 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ECHDC1Q9NTX5 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ECHDC1Q9NTX5 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ECHDC1Q9NTX5 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ECHDC1Q9NTX5 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ECHDC1Q9NTX5 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ECHDC1Q9NTX5 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ECHDC1Q9NTX5 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ECHDC1Q9NTX5 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ECHDC1Q9NTX5 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ECHDC1Q9NTX5 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ECHDC1Q9NTX5 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
ECHDC1Q9NTX5 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
ECHDC1Q9NTX5 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
ECHDC1Q9NTX5 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ECHDC1Q9NTX5 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ECHDC1Q9NTX5 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ECHDC1Q9NTX5 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ECHDC1Q9NTX5 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ECHDC1Q9NTX5 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ECHDC1Q9NTX5 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ECHDC1Q9NTX5 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ECHDC1Q9NTX5 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ECHDC1Q9NTX5 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ECHDC1Q9NTX5 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ECHDC1Q9NTX5 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ECHDC1Q9NTX5 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ECHDC1Q9NTX5 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ECHDC1Q9NTX5 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ECHDC1Q9NTX5 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ECHDC1Q9NTX5 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ECHDC1Q9NTX5 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ECHDC1Q9NTX5 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ECHDC1Q9NTX5 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ECHDC1Q9NTX5 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ECHDC1Q9NTX5 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ECHDC1Q9NTX5 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ECHDC1Q9NTX5 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ECHDC1Q9NTX5 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ECHDC1Q9NTX5 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ECHDC1Q9NTX5 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ECHDC1Q9NTX5 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ECHDC1Q9NTX5 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ECHDC1Q9NTX5 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ECHDC1Q9NTX5 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ECHDC1Q9NTX5 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ECHDC1Q9NTX5 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ECHDC1Q9NTX5 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ECHDC1Q9NTX5 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ECHDC1Q9NTX5 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ECHDC1Q9NTX5 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ECHDC1Q9NTX5 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
ECHDC1Q9NTX5 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ECHDC1Q9NTX5 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ECHDC1Q9NTX5 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ECHDC1Q9NTX5 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ECHDC1Q9NTX5 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
ECHDC1Q9NTX5 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
ECHDC1Q9NTX5 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ECHDC1Q9NTX5 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ECHDC1Q9NTX5 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ECHDC1Q9NTX5 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ECHDC1Q9NTX5 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ECHDC1Q9NTX5 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ECHDC1Q9NTX5 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ECHDC1Q9NTX5 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
ECHDC1Q9NTX5 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ECHDC1Q9NTX5 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ECHDC1Q9NTX5 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ECHDC1Q9NTX5 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ECHDC1Q9NTX5 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ECHDC1Q9NTX5 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ECHDC1Q9NTX5 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms