Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTI2

ATP8A2, Phospholipid-transporting ATPase IB, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8A2Q9NTI2 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATP8A2Q9NTI2 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATP8A2Q9NTI2 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATP8A2Q9NTI2 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATP8A2Q9NTI2 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATP8A2Q9NTI2 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATP8A2Q9NTI2 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATP8A2Q9NTI2 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATP8A2Q9NTI2 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATP8A2Q9NTI2 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATP8A2Q9NTI2 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATP8A2Q9NTI2 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATP8A2Q9NTI2 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATP8A2Q9NTI2 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATP8A2Q9NTI2 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATP8A2Q9NTI2 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
ATP8A2Q9NTI2 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
ATP8A2Q9NTI2 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATP8A2Q9NTI2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATP8A2Q9NTI2 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATP8A2Q9NTI2 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATP8A2Q9NTI2 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
ATP8A2Q9NTI2 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
ATP8A2Q9NTI2 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATP8A2Q9NTI2 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATP8A2Q9NTI2 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATP8A2Q9NTI2 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATP8A2Q9NTI2 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
ATP8A2Q9NTI2 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ATP8A2Q9NTI2 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
ATP8A2Q9NTI2 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ATP8A2Q9NTI2 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
ATP8A2Q9NTI2 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATP8A2Q9NTI2 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATP8A2Q9NTI2 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATP8A2Q9NTI2 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATP8A2Q9NTI2 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATP8A2Q9NTI2 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATP8A2Q9NTI2 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATP8A2Q9NTI2 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
ATP8A2Q9NTI2 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATP8A2Q9NTI2 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATP8A2Q9NTI2 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
ATP8A2Q9NTI2 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
ATP8A2Q9NTI2 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATP8A2Q9NTI2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATP8A2Q9NTI2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATP8A2Q9NTI2 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATP8A2Q9NTI2 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATP8A2Q9NTI2 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATP8A2Q9NTI2 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATP8A2Q9NTI2 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATP8A2Q9NTI2 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
ATP8A2Q9NTI2 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
ATP8A2Q9NTI2 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
ATP8A2Q9NTI2 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATP8A2Q9NTI2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATP8A2Q9NTI2 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATP8A2Q9NTI2 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATP8A2Q9NTI2 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
ATP8A2Q9NTI2 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
ATP8A2Q9NTI2 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATP8A2Q9NTI2 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
ATP8A2Q9NTI2 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ATP8A2Q9NTI2 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ATP8A2Q9NTI2 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ATP8A2Q9NTI2 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ATP8A2Q9NTI2 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ATP8A2Q9NTI2 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ATP8A2Q9NTI2 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ATP8A2Q9NTI2 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ATP8A2Q9NTI2 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ATP8A2Q9NTI2 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ATP8A2Q9NTI2 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ATP8A2Q9NTI2 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ATP8A2Q9NTI2 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ATP8A2Q9NTI2 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ATP8A2Q9NTI2 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ATP8A2Q9NTI2 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ATP8A2Q9NTI2 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ATP8A2Q9NTI2 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ATP8A2Q9NTI2 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ATP8A2Q9NTI2 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ATP8A2Q9NTI2 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
ATP8A2Q9NTI2 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
ATP8A2Q9NTI2 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
ATP8A2Q9NTI2 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ATP8A2Q9NTI2 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ATP8A2Q9NTI2 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ATP8A2Q9NTI2 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ATP8A2Q9NTI2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ATP8A2Q9NTI2 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ATP8A2Q9NTI2 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ATP8A2Q9NTI2 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ATP8A2Q9NTI2 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ATP8A2Q9NTI2 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ATP8A2Q9NTI2 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ATP8A2Q9NTI2 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ATP8A2Q9NTI2 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ATP8A2Q9NTI2 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms