Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD4

ZNF275, Zinc finger protein 275, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF275Q9NSD4 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNF275Q9NSD4 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNF275Q9NSD4 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNF275Q9NSD4 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNF275Q9NSD4 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNF275Q9NSD4 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNF275Q9NSD4 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNF275Q9NSD4 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
ZNF275Q9NSD4 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
ZNF275Q9NSD4 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF275Q9NSD4 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF275Q9NSD4 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF275Q9NSD4 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF275Q9NSD4 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF275Q9NSD4 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF275Q9NSD4 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF275Q9NSD4 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF275Q9NSD4 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF275Q9NSD4 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF275Q9NSD4 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF275Q9NSD4 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF275Q9NSD4 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF275Q9NSD4 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF275Q9NSD4 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF275Q9NSD4 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF275Q9NSD4 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF275Q9NSD4 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF275Q9NSD4 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF275Q9NSD4 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF275Q9NSD4 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF275Q9NSD4 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF275Q9NSD4 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF275Q9NSD4 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF275Q9NSD4 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF275Q9NSD4 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF275Q9NSD4 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF275Q9NSD4 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF275Q9NSD4 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF275Q9NSD4 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF275Q9NSD4 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF275Q9NSD4 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF275Q9NSD4 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF275Q9NSD4 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF275Q9NSD4 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF275Q9NSD4 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF275Q9NSD4 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF275Q9NSD4 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF275Q9NSD4 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF275Q9NSD4 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF275Q9NSD4 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF275Q9NSD4 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF275Q9NSD4 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF275Q9NSD4 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF275Q9NSD4 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF275Q9NSD4 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF275Q9NSD4 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF275Q9NSD4 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF275Q9NSD4 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF275Q9NSD4 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF275Q9NSD4 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF275Q9NSD4 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF275Q9NSD4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF275Q9NSD4 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF275Q9NSD4 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF275Q9NSD4 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF275Q9NSD4 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF275Q9NSD4 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF275Q9NSD4 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF275Q9NSD4 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF275Q9NSD4 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF275Q9NSD4 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF275Q9NSD4 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF275Q9NSD4 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF275Q9NSD4 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF275Q9NSD4 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF275Q9NSD4 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF275Q9NSD4 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF275Q9NSD4 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF275Q9NSD4 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF275Q9NSD4 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF275Q9NSD4 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF275Q9NSD4 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF275Q9NSD4 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF275Q9NSD4 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF275Q9NSD4 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF275Q9NSD4 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF275Q9NSD4 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF275Q9NSD4 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF275Q9NSD4 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF275Q9NSD4 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
ZNF275Q9NSD4 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF275Q9NSD4 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF275Q9NSD4 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF275Q9NSD4 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF275Q9NSD4 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF275Q9NSD4 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF275Q9NSD4 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF275Q9NSD4 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF275Q9NSD4 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF275Q9NSD4 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms