Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms