Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX4

PHPT1, 14 kDa phosphohistidine phosphatase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHPT1Q9NRX4 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHPT1Q9NRX4 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHPT1Q9NRX4 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PHPT1Q9NRX4 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHPT1Q9NRX4 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PHPT1Q9NRX4 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHPT1Q9NRX4 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHPT1Q9NRX4 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHPT1Q9NRX4 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PHPT1Q9NRX4 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PHPT1Q9NRX4 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PHPT1Q9NRX4 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PHPT1Q9NRX4 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PHPT1Q9NRX4 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PHPT1Q9NRX4 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHPT1Q9NRX4 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHPT1Q9NRX4 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHPT1Q9NRX4 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHPT1Q9NRX4 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHPT1Q9NRX4 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHPT1Q9NRX4 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHPT1Q9NRX4 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PHPT1Q9NRX4 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHPT1Q9NRX4 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHPT1Q9NRX4 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHPT1Q9NRX4 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PHPT1Q9NRX4 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
PHPT1Q9NRX4 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PHPT1Q9NRX4 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PHPT1Q9NRX4 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PHPT1Q9NRX4 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PHPT1Q9NRX4 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PHPT1Q9NRX4 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PHPT1Q9NRX4 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PHPT1Q9NRX4 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PHPT1Q9NRX4 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PHPT1Q9NRX4 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PHPT1Q9NRX4 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PHPT1Q9NRX4 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHPT1Q9NRX4 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHPT1Q9NRX4 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHPT1Q9NRX4 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHPT1Q9NRX4 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHPT1Q9NRX4 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHPT1Q9NRX4 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHPT1Q9NRX4 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHPT1Q9NRX4 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHPT1Q9NRX4 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHPT1Q9NRX4 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHPT1Q9NRX4 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHPT1Q9NRX4 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHPT1Q9NRX4 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHPT1Q9NRX4 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHPT1Q9NRX4 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHPT1Q9NRX4 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHPT1Q9NRX4 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PHPT1Q9NRX4 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PHPT1Q9NRX4 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PHPT1Q9NRX4 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PHPT1Q9NRX4 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PHPT1Q9NRX4 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PHPT1Q9NRX4 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHPT1Q9NRX4 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHPT1Q9NRX4 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHPT1Q9NRX4 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHPT1Q9NRX4 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHPT1Q9NRX4 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHPT1Q9NRX4 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHPT1Q9NRX4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHPT1Q9NRX4 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHPT1Q9NRX4 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHPT1Q9NRX4 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHPT1Q9NRX4 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHPT1Q9NRX4 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHPT1Q9NRX4 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHPT1Q9NRX4 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHPT1Q9NRX4 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHPT1Q9NRX4 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHPT1Q9NRX4 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PHPT1Q9NRX4 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHPT1Q9NRX4 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHPT1Q9NRX4 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHPT1Q9NRX4 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PHPT1Q9NRX4 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHPT1Q9NRX4 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHPT1Q9NRX4 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHPT1Q9NRX4 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHPT1Q9NRX4 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHPT1Q9NRX4 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHPT1Q9NRX4 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHPT1Q9NRX4 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PHPT1Q9NRX4 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHPT1Q9NRX4 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHPT1Q9NRX4 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHPT1Q9NRX4 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHPT1Q9NRX4 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PHPT1Q9NRX4 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PHPT1Q9NRX4 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PHPT1Q9NRX4 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PHPT1Q9NRX4 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms