Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW7

VPS45, Vacuolar protein sorting-associated protein 45, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS45Q9NRW7 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VPS45Q9NRW7 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VPS45Q9NRW7 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VPS45Q9NRW7 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VPS45Q9NRW7 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VPS45Q9NRW7 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VPS45Q9NRW7 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VPS45Q9NRW7 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VPS45Q9NRW7 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VPS45Q9NRW7 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VPS45Q9NRW7 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
VPS45Q9NRW7 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VPS45Q9NRW7 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VPS45Q9NRW7 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VPS45Q9NRW7 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VPS45Q9NRW7 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VPS45Q9NRW7 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VPS45Q9NRW7 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
VPS45Q9NRW7 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VPS45Q9NRW7 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VPS45Q9NRW7 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VPS45Q9NRW7 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VPS45Q9NRW7 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
VPS45Q9NRW7 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VPS45Q9NRW7 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
VPS45Q9NRW7 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VPS45Q9NRW7 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VPS45Q9NRW7 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VPS45Q9NRW7 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VPS45Q9NRW7 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VPS45Q9NRW7 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VPS45Q9NRW7 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VPS45Q9NRW7 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VPS45Q9NRW7 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VPS45Q9NRW7 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
VPS45Q9NRW7 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VPS45Q9NRW7 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VPS45Q9NRW7 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VPS45Q9NRW7 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VPS45Q9NRW7 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VPS45Q9NRW7 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VPS45Q9NRW7 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VPS45Q9NRW7 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VPS45Q9NRW7 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VPS45Q9NRW7 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VPS45Q9NRW7 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VPS45Q9NRW7 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VPS45Q9NRW7 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VPS45Q9NRW7 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VPS45Q9NRW7 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VPS45Q9NRW7 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
VPS45Q9NRW7 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VPS45Q9NRW7 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
VPS45Q9NRW7 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VPS45Q9NRW7 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VPS45Q9NRW7 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VPS45Q9NRW7 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VPS45Q9NRW7 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
VPS45Q9NRW7 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
VPS45Q9NRW7 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
VPS45Q9NRW7 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
VPS45Q9NRW7 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VPS45Q9NRW7 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
VPS45Q9NRW7 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
VPS45Q9NRW7 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
VPS45Q9NRW7 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
VPS45Q9NRW7 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
VPS45Q9NRW7 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VPS45Q9NRW7 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VPS45Q9NRW7 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VPS45Q9NRW7 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VPS45Q9NRW7 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VPS45Q9NRW7 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VPS45Q9NRW7 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VPS45Q9NRW7 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VPS45Q9NRW7 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VPS45Q9NRW7 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VPS45Q9NRW7 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VPS45Q9NRW7 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
VPS45Q9NRW7 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VPS45Q9NRW7 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VPS45Q9NRW7 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VPS45Q9NRW7 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VPS45Q9NRW7 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VPS45Q9NRW7 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VPS45Q9NRW7 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VPS45Q9NRW7 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VPS45Q9NRW7 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VPS45Q9NRW7 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VPS45Q9NRW7 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VPS45Q9NRW7 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VPS45Q9NRW7 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VPS45Q9NRW7 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VPS45Q9NRW7 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VPS45Q9NRW7 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
VPS45Q9NRW7 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VPS45Q9NRW7 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
VPS45Q9NRW7 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VPS45Q9NRW7 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VPS45Q9NRW7 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.2 ms