Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRU3

CNNM1, Metal transporter CNNM1, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM1Q9NRU3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CNNM1Q9NRU3 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CNNM1Q9NRU3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CNNM1Q9NRU3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CNNM1Q9NRU3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CNNM1Q9NRU3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CNNM1Q9NRU3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CNNM1Q9NRU3 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CNNM1Q9NRU3 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CNNM1Q9NRU3 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CNNM1Q9NRU3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CNNM1Q9NRU3 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CNNM1Q9NRU3 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CNNM1Q9NRU3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CNNM1Q9NRU3 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CNNM1Q9NRU3 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CNNM1Q9NRU3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CNNM1Q9NRU3 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CNNM1Q9NRU3 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CNNM1Q9NRU3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CNNM1Q9NRU3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CNNM1Q9NRU3 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
CNNM1Q9NRU3 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
CNNM1Q9NRU3 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CNNM1Q9NRU3 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CNNM1Q9NRU3 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
CNNM1Q9NRU3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CNNM1Q9NRU3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CNNM1Q9NRU3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CNNM1Q9NRU3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CNNM1Q9NRU3 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CNNM1Q9NRU3 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CNNM1Q9NRU3 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CNNM1Q9NRU3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CNNM1Q9NRU3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CNNM1Q9NRU3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CNNM1Q9NRU3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CNNM1Q9NRU3 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CNNM1Q9NRU3 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CNNM1Q9NRU3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CNNM1Q9NRU3 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CNNM1Q9NRU3 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CNNM1Q9NRU3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CNNM1Q9NRU3 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CNNM1Q9NRU3 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
CNNM1Q9NRU3 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
CNNM1Q9NRU3 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
CNNM1Q9NRU3 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
CNNM1Q9NRU3 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CNNM1Q9NRU3 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CNNM1Q9NRU3 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CNNM1Q9NRU3 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CNNM1Q9NRU3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CNNM1Q9NRU3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CNNM1Q9NRU3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CNNM1Q9NRU3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CNNM1Q9NRU3 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CNNM1Q9NRU3 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
CNNM1Q9NRU3 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CNNM1Q9NRU3 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CNNM1Q9NRU3 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CNNM1Q9NRU3 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CNNM1Q9NRU3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CNNM1Q9NRU3 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CNNM1Q9NRU3 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CNNM1Q9NRU3 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CNNM1Q9NRU3 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CNNM1Q9NRU3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CNNM1Q9NRU3 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CNNM1Q9NRU3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CNNM1Q9NRU3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CNNM1Q9NRU3 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CNNM1Q9NRU3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CNNM1Q9NRU3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CNNM1Q9NRU3 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CNNM1Q9NRU3 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
CNNM1Q9NRU3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CNNM1Q9NRU3 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CNNM1Q9NRU3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CNNM1Q9NRU3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CNNM1Q9NRU3 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CNNM1Q9NRU3 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
CNNM1Q9NRU3 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CNNM1Q9NRU3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CNNM1Q9NRU3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CNNM1Q9NRU3 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CNNM1Q9NRU3 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
CNNM1Q9NRU3 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
CNNM1Q9NRU3 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
CNNM1Q9NRU3 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
CNNM1Q9NRU3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CNNM1Q9NRU3 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CNNM1Q9NRU3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CNNM1Q9NRU3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CNNM1Q9NRU3 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CNNM1Q9NRU3 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CNNM1Q9NRU3 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CNNM1Q9NRU3 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CNNM1Q9NRU3 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CNNM1Q9NRU3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms