Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQS7

INCENP, Inner centromere protein, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INCENPQ9NQS7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
INCENPQ9NQS7 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
INCENPQ9NQS7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
INCENPQ9NQS7 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
INCENPQ9NQS7 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
INCENPQ9NQS7 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
INCENPQ9NQS7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
INCENPQ9NQS7 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
INCENPQ9NQS7 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
INCENPQ9NQS7 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
INCENPQ9NQS7 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
INCENPQ9NQS7 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
INCENPQ9NQS7 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
INCENPQ9NQS7 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
INCENPQ9NQS7 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
INCENPQ9NQS7 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
INCENPQ9NQS7 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
INCENPQ9NQS7 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
INCENPQ9NQS7 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
INCENPQ9NQS7 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
INCENPQ9NQS7 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
INCENPQ9NQS7 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
INCENPQ9NQS7 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
INCENPQ9NQS7 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
INCENPQ9NQS7 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
INCENPQ9NQS7 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
INCENPQ9NQS7 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
INCENPQ9NQS7 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
INCENPQ9NQS7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
INCENPQ9NQS7 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
INCENPQ9NQS7 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
INCENPQ9NQS7 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
INCENPQ9NQS7 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
INCENPQ9NQS7 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
INCENPQ9NQS7 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
INCENPQ9NQS7 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
INCENPQ9NQS7 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
INCENPQ9NQS7 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
INCENPQ9NQS7 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
INCENPQ9NQS7 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
INCENPQ9NQS7 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
INCENPQ9NQS7 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
INCENPQ9NQS7 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
INCENPQ9NQS7 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
INCENPQ9NQS7 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
INCENPQ9NQS7 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
INCENPQ9NQS7 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
INCENPQ9NQS7 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
INCENPQ9NQS7 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
INCENPQ9NQS7 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
INCENPQ9NQS7 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
INCENPQ9NQS7 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
INCENPQ9NQS7 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
INCENPQ9NQS7 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
INCENPQ9NQS7 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
INCENPQ9NQS7 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
INCENPQ9NQS7 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
INCENPQ9NQS7 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
INCENPQ9NQS7 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
INCENPQ9NQS7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
INCENPQ9NQS7 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
INCENPQ9NQS7 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
INCENPQ9NQS7 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
INCENPQ9NQS7 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
INCENPQ9NQS7 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
INCENPQ9NQS7 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
INCENPQ9NQS7 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
INCENPQ9NQS7 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
INCENPQ9NQS7 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
INCENPQ9NQS7 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
INCENPQ9NQS7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
INCENPQ9NQS7 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
INCENPQ9NQS7 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
INCENPQ9NQS7 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
INCENPQ9NQS7 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
INCENPQ9NQS7 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
INCENPQ9NQS7 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
INCENPQ9NQS7 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
INCENPQ9NQS7 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
INCENPQ9NQS7 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
INCENPQ9NQS7 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
INCENPQ9NQS7 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
INCENPQ9NQS7 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
INCENPQ9NQS7 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
INCENPQ9NQS7 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
INCENPQ9NQS7 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
INCENPQ9NQS7 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
INCENPQ9NQS7 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
INCENPQ9NQS7 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
INCENPQ9NQS7 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
INCENPQ9NQS7 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
INCENPQ9NQS7 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
INCENPQ9NQS7 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
INCENPQ9NQS7 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
INCENPQ9NQS7 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
INCENPQ9NQS7 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
INCENPQ9NQS7 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
INCENPQ9NQS7 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
INCENPQ9NQS7 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
INCENPQ9NQS7 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms