Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQP4

PFDN4, Prefoldin subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN4Q9NQP4 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PFDN4Q9NQP4 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PFDN4Q9NQP4 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PFDN4Q9NQP4 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PFDN4Q9NQP4 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PFDN4Q9NQP4 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PFDN4Q9NQP4 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PFDN4Q9NQP4 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PFDN4Q9NQP4 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PFDN4Q9NQP4 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PFDN4Q9NQP4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PFDN4Q9NQP4 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PFDN4Q9NQP4 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PFDN4Q9NQP4 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PFDN4Q9NQP4 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PFDN4Q9NQP4 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PFDN4Q9NQP4 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PFDN4Q9NQP4 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PFDN4Q9NQP4 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PFDN4Q9NQP4 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PFDN4Q9NQP4 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PFDN4Q9NQP4 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PFDN4Q9NQP4 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PFDN4Q9NQP4 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PFDN4Q9NQP4 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PFDN4Q9NQP4 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PFDN4Q9NQP4 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PFDN4Q9NQP4 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PFDN4Q9NQP4 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PFDN4Q9NQP4 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PFDN4Q9NQP4 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PFDN4Q9NQP4 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PFDN4Q9NQP4 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PFDN4Q9NQP4 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PFDN4Q9NQP4 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PFDN4Q9NQP4 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PFDN4Q9NQP4 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PFDN4Q9NQP4 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PFDN4Q9NQP4 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PFDN4Q9NQP4 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PFDN4Q9NQP4 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PFDN4Q9NQP4 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PFDN4Q9NQP4 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PFDN4Q9NQP4 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PFDN4Q9NQP4 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PFDN4Q9NQP4 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PFDN4Q9NQP4 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PFDN4Q9NQP4 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PFDN4Q9NQP4 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PFDN4Q9NQP4 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PFDN4Q9NQP4 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PFDN4Q9NQP4 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PFDN4Q9NQP4 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PFDN4Q9NQP4 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PFDN4Q9NQP4 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PFDN4Q9NQP4 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PFDN4Q9NQP4 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PFDN4Q9NQP4 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PFDN4Q9NQP4 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PFDN4Q9NQP4 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PFDN4Q9NQP4 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PFDN4Q9NQP4 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PFDN4Q9NQP4 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PFDN4Q9NQP4 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PFDN4Q9NQP4 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PFDN4Q9NQP4 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PFDN4Q9NQP4 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PFDN4Q9NQP4 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PFDN4Q9NQP4 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PFDN4Q9NQP4 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PFDN4Q9NQP4 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PFDN4Q9NQP4 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PFDN4Q9NQP4 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PFDN4Q9NQP4 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PFDN4Q9NQP4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PFDN4Q9NQP4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PFDN4Q9NQP4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PFDN4Q9NQP4 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PFDN4Q9NQP4 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PFDN4Q9NQP4 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PFDN4Q9NQP4 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PFDN4Q9NQP4 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PFDN4Q9NQP4 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PFDN4Q9NQP4 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PFDN4Q9NQP4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PFDN4Q9NQP4 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PFDN4Q9NQP4 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PFDN4Q9NQP4 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PFDN4Q9NQP4 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PFDN4Q9NQP4 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PFDN4Q9NQP4 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PFDN4Q9NQP4 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PFDN4Q9NQP4 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PFDN4Q9NQP4 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PFDN4Q9NQP4 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PFDN4Q9NQP4 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PFDN4Q9NQP4 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PFDN4Q9NQP4 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PFDN4Q9NQP4 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PFDN4Q9NQP4 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms