Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR2

SEMA4B, Semaphorin-4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4BQ9NPR2 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEMA4BQ9NPR2 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEMA4BQ9NPR2 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEMA4BQ9NPR2 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEMA4BQ9NPR2 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEMA4BQ9NPR2 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEMA4BQ9NPR2 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEMA4BQ9NPR2 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEMA4BQ9NPR2 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEMA4BQ9NPR2 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEMA4BQ9NPR2 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEMA4BQ9NPR2 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEMA4BQ9NPR2 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SEMA4BQ9NPR2 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEMA4BQ9NPR2 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
SEMA4BQ9NPR2 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SEMA4BQ9NPR2 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SEMA4BQ9NPR2 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEMA4BQ9NPR2 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEMA4BQ9NPR2 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEMA4BQ9NPR2 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEMA4BQ9NPR2 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEMA4BQ9NPR2 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEMA4BQ9NPR2 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEMA4BQ9NPR2 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEMA4BQ9NPR2 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEMA4BQ9NPR2 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEMA4BQ9NPR2 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEMA4BQ9NPR2 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEMA4BQ9NPR2 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEMA4BQ9NPR2 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEMA4BQ9NPR2 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SEMA4BQ9NPR2 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEMA4BQ9NPR2 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEMA4BQ9NPR2 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SEMA4BQ9NPR2 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEMA4BQ9NPR2 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEMA4BQ9NPR2 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEMA4BQ9NPR2 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEMA4BQ9NPR2 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEMA4BQ9NPR2 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEMA4BQ9NPR2 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEMA4BQ9NPR2 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SEMA4BQ9NPR2 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEMA4BQ9NPR2 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEMA4BQ9NPR2 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEMA4BQ9NPR2 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEMA4BQ9NPR2 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEMA4BQ9NPR2 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEMA4BQ9NPR2 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEMA4BQ9NPR2 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEMA4BQ9NPR2 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEMA4BQ9NPR2 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEMA4BQ9NPR2 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEMA4BQ9NPR2 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEMA4BQ9NPR2 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEMA4BQ9NPR2 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEMA4BQ9NPR2 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEMA4BQ9NPR2 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEMA4BQ9NPR2 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEMA4BQ9NPR2 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEMA4BQ9NPR2 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEMA4BQ9NPR2 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEMA4BQ9NPR2 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEMA4BQ9NPR2 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SEMA4BQ9NPR2 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEMA4BQ9NPR2 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEMA4BQ9NPR2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEMA4BQ9NPR2 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEMA4BQ9NPR2 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEMA4BQ9NPR2 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEMA4BQ9NPR2 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEMA4BQ9NPR2 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEMA4BQ9NPR2 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEMA4BQ9NPR2 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEMA4BQ9NPR2 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEMA4BQ9NPR2 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEMA4BQ9NPR2 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEMA4BQ9NPR2 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEMA4BQ9NPR2 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEMA4BQ9NPR2 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEMA4BQ9NPR2 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEMA4BQ9NPR2 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SEMA4BQ9NPR2 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SEMA4BQ9NPR2 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SEMA4BQ9NPR2 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SEMA4BQ9NPR2 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SEMA4BQ9NPR2 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEMA4BQ9NPR2 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEMA4BQ9NPR2 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEMA4BQ9NPR2 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEMA4BQ9NPR2 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEMA4BQ9NPR2 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEMA4BQ9NPR2 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEMA4BQ9NPR2 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEMA4BQ9NPR2 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEMA4BQ9NPR2 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEMA4BQ9NPR2 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEMA4BQ9NPR2 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEMA4BQ9NPR2 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms