Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG1

FZD3, Frizzled-3, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD3Q9NPG1 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FZD3Q9NPG1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FZD3Q9NPG1 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FZD3Q9NPG1 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
FZD3Q9NPG1 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FZD3Q9NPG1 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FZD3Q9NPG1 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
FZD3Q9NPG1 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
FZD3Q9NPG1 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FZD3Q9NPG1 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
FZD3Q9NPG1 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FZD3Q9NPG1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FZD3Q9NPG1 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FZD3Q9NPG1 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FZD3Q9NPG1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FZD3Q9NPG1 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FZD3Q9NPG1 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FZD3Q9NPG1 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
FZD3Q9NPG1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FZD3Q9NPG1 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FZD3Q9NPG1 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FZD3Q9NPG1 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
FZD3Q9NPG1 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FZD3Q9NPG1 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
FZD3Q9NPG1 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
FZD3Q9NPG1 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FZD3Q9NPG1 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FZD3Q9NPG1 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
FZD3Q9NPG1 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
FZD3Q9NPG1 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
FZD3Q9NPG1 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
FZD3Q9NPG1 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FZD3Q9NPG1 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
FZD3Q9NPG1 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
FZD3Q9NPG1 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FZD3Q9NPG1 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FZD3Q9NPG1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FZD3Q9NPG1 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FZD3Q9NPG1 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FZD3Q9NPG1 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FZD3Q9NPG1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FZD3Q9NPG1 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FZD3Q9NPG1 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FZD3Q9NPG1 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FZD3Q9NPG1 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FZD3Q9NPG1 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FZD3Q9NPG1 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
FZD3Q9NPG1 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FZD3Q9NPG1 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
FZD3Q9NPG1 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
FZD3Q9NPG1 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FZD3Q9NPG1 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FZD3Q9NPG1 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FZD3Q9NPG1 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FZD3Q9NPG1 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FZD3Q9NPG1 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FZD3Q9NPG1 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FZD3Q9NPG1 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FZD3Q9NPG1 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FZD3Q9NPG1 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FZD3Q9NPG1 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FZD3Q9NPG1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
FZD3Q9NPG1 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FZD3Q9NPG1 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FZD3Q9NPG1 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FZD3Q9NPG1 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FZD3Q9NPG1 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FZD3Q9NPG1 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FZD3Q9NPG1 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FZD3Q9NPG1 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FZD3Q9NPG1 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FZD3Q9NPG1 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FZD3Q9NPG1 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FZD3Q9NPG1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FZD3Q9NPG1 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FZD3Q9NPG1 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FZD3Q9NPG1 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FZD3Q9NPG1 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FZD3Q9NPG1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FZD3Q9NPG1 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FZD3Q9NPG1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FZD3Q9NPG1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FZD3Q9NPG1 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FZD3Q9NPG1 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FZD3Q9NPG1 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
FZD3Q9NPG1 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FZD3Q9NPG1 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FZD3Q9NPG1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FZD3Q9NPG1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FZD3Q9NPG1 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FZD3Q9NPG1 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FZD3Q9NPG1 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FZD3Q9NPG1 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FZD3Q9NPG1 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FZD3Q9NPG1 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
FZD3Q9NPG1 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FZD3Q9NPG1 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FZD3Q9NPG1 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FZD3Q9NPG1 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FZD3Q9NPG1 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms