Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPB6

PARD6A, Partitioning defective 6 homolog alpha, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARD6AQ9NPB6 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PARD6AQ9NPB6 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PARD6AQ9NPB6 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PARD6AQ9NPB6 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PARD6AQ9NPB6 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PARD6AQ9NPB6 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PARD6AQ9NPB6 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PARD6AQ9NPB6 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PARD6AQ9NPB6 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PARD6AQ9NPB6 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PARD6AQ9NPB6 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PARD6AQ9NPB6 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PARD6AQ9NPB6 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PARD6AQ9NPB6 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PARD6AQ9NPB6 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PARD6AQ9NPB6 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PARD6AQ9NPB6 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PARD6AQ9NPB6 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PARD6AQ9NPB6 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PARD6AQ9NPB6 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PARD6AQ9NPB6 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PARD6AQ9NPB6 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PARD6AQ9NPB6 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PARD6AQ9NPB6 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PARD6AQ9NPB6 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PARD6AQ9NPB6 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PARD6AQ9NPB6 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PARD6AQ9NPB6 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PARD6AQ9NPB6 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PARD6AQ9NPB6 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PARD6AQ9NPB6 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PARD6AQ9NPB6 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PARD6AQ9NPB6 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PARD6AQ9NPB6 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PARD6AQ9NPB6 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PARD6AQ9NPB6 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PARD6AQ9NPB6 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PARD6AQ9NPB6 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PARD6AQ9NPB6 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PARD6AQ9NPB6 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PARD6AQ9NPB6 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PARD6AQ9NPB6 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PARD6AQ9NPB6 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PARD6AQ9NPB6 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PARD6AQ9NPB6 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PARD6AQ9NPB6 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PARD6AQ9NPB6 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PARD6AQ9NPB6 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PARD6AQ9NPB6 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PARD6AQ9NPB6 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PARD6AQ9NPB6 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PARD6AQ9NPB6 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PARD6AQ9NPB6 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PARD6AQ9NPB6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PARD6AQ9NPB6 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PARD6AQ9NPB6 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PARD6AQ9NPB6 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PARD6AQ9NPB6 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PARD6AQ9NPB6 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PARD6AQ9NPB6 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PARD6AQ9NPB6 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PARD6AQ9NPB6 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PARD6AQ9NPB6 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PARD6AQ9NPB6 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PARD6AQ9NPB6 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PARD6AQ9NPB6 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PARD6AQ9NPB6 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PARD6AQ9NPB6 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PARD6AQ9NPB6 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PARD6AQ9NPB6 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PARD6AQ9NPB6 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PARD6AQ9NPB6 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PARD6AQ9NPB6 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PARD6AQ9NPB6 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PARD6AQ9NPB6 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PARD6AQ9NPB6 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PARD6AQ9NPB6 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PARD6AQ9NPB6 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PARD6AQ9NPB6 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PARD6AQ9NPB6 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PARD6AQ9NPB6 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PARD6AQ9NPB6 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PARD6AQ9NPB6 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PARD6AQ9NPB6 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PARD6AQ9NPB6 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PARD6AQ9NPB6 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PARD6AQ9NPB6 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PARD6AQ9NPB6 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PARD6AQ9NPB6 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PARD6AQ9NPB6 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PARD6AQ9NPB6 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PARD6AQ9NPB6 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PARD6AQ9NPB6 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PARD6AQ9NPB6 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PARD6AQ9NPB6 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PARD6AQ9NPB6 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PARD6AQ9NPB6 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PARD6AQ9NPB6 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PARD6AQ9NPB6 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PARD6AQ9NPB6 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms