Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP84

TNFRSF12A, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 12A, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF12AQ9NP84 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNFRSF12AQ9NP84 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNFRSF12AQ9NP84 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNFRSF12AQ9NP84 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNFRSF12AQ9NP84 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TNFRSF12AQ9NP84 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNFRSF12AQ9NP84 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNFRSF12AQ9NP84 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNFRSF12AQ9NP84 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNFRSF12AQ9NP84 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNFRSF12AQ9NP84 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNFRSF12AQ9NP84 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNFRSF12AQ9NP84 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNFRSF12AQ9NP84 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNFRSF12AQ9NP84 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TNFRSF12AQ9NP84 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNFRSF12AQ9NP84 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNFRSF12AQ9NP84 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNFRSF12AQ9NP84 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNFRSF12AQ9NP84 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNFRSF12AQ9NP84 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNFRSF12AQ9NP84 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNFRSF12AQ9NP84 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNFRSF12AQ9NP84 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNFRSF12AQ9NP84 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNFRSF12AQ9NP84 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNFRSF12AQ9NP84 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNFRSF12AQ9NP84 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNFRSF12AQ9NP84 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNFRSF12AQ9NP84 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNFRSF12AQ9NP84 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNFRSF12AQ9NP84 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNFRSF12AQ9NP84 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNFRSF12AQ9NP84 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNFRSF12AQ9NP84 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNFRSF12AQ9NP84 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNFRSF12AQ9NP84 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNFRSF12AQ9NP84 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNFRSF12AQ9NP84 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNFRSF12AQ9NP84 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNFRSF12AQ9NP84 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNFRSF12AQ9NP84 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNFRSF12AQ9NP84 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNFRSF12AQ9NP84 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNFRSF12AQ9NP84 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNFRSF12AQ9NP84 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNFRSF12AQ9NP84 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TNFRSF12AQ9NP84 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TNFRSF12AQ9NP84 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNFRSF12AQ9NP84 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNFRSF12AQ9NP84 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNFRSF12AQ9NP84 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TNFRSF12AQ9NP84 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNFRSF12AQ9NP84 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNFRSF12AQ9NP84 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNFRSF12AQ9NP84 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNFRSF12AQ9NP84 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNFRSF12AQ9NP84 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TNFRSF12AQ9NP84 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNFRSF12AQ9NP84 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNFRSF12AQ9NP84 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNFRSF12AQ9NP84 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNFRSF12AQ9NP84 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNFRSF12AQ9NP84 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNFRSF12AQ9NP84 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNFRSF12AQ9NP84 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TNFRSF12AQ9NP84 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TNFRSF12AQ9NP84 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TNFRSF12AQ9NP84 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNFRSF12AQ9NP84 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNFRSF12AQ9NP84 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNFRSF12AQ9NP84 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNFRSF12AQ9NP84 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TNFRSF12AQ9NP84 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNFRSF12AQ9NP84 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNFRSF12AQ9NP84 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNFRSF12AQ9NP84 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNFRSF12AQ9NP84 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNFRSF12AQ9NP84 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TNFRSF12AQ9NP84 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TNFRSF12AQ9NP84 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TNFRSF12AQ9NP84 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TNFRSF12AQ9NP84 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TNFRSF12AQ9NP84 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TNFRSF12AQ9NP84 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TNFRSF12AQ9NP84 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TNFRSF12AQ9NP84 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNFRSF12AQ9NP84 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNFRSF12AQ9NP84 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNFRSF12AQ9NP84 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNFRSF12AQ9NP84 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNFRSF12AQ9NP84 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNFRSF12AQ9NP84 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TNFRSF12AQ9NP84 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNFRSF12AQ9NP84 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TNFRSF12AQ9NP84 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNFRSF12AQ9NP84 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNFRSF12AQ9NP84 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNFRSF12AQ9NP84 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNFRSF12AQ9NP84 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.9 ms