Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP66

HMG20A, High mobility group protein 20A, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20AQ9NP66 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HMG20AQ9NP66 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
HMG20AQ9NP66 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HMG20AQ9NP66 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HMG20AQ9NP66 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HMG20AQ9NP66 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HMG20AQ9NP66 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HMG20AQ9NP66 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HMG20AQ9NP66 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HMG20AQ9NP66 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HMG20AQ9NP66 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HMG20AQ9NP66 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HMG20AQ9NP66 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HMG20AQ9NP66 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HMG20AQ9NP66 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HMG20AQ9NP66 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HMG20AQ9NP66 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HMG20AQ9NP66 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HMG20AQ9NP66 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HMG20AQ9NP66 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HMG20AQ9NP66 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HMG20AQ9NP66 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HMG20AQ9NP66 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HMG20AQ9NP66 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HMG20AQ9NP66 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HMG20AQ9NP66 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HMG20AQ9NP66 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HMG20AQ9NP66 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HMG20AQ9NP66 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HMG20AQ9NP66 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HMG20AQ9NP66 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HMG20AQ9NP66 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HMG20AQ9NP66 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HMG20AQ9NP66 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HMG20AQ9NP66 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HMG20AQ9NP66 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HMG20AQ9NP66 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HMG20AQ9NP66 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HMG20AQ9NP66 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HMG20AQ9NP66 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HMG20AQ9NP66 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HMG20AQ9NP66 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HMG20AQ9NP66 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HMG20AQ9NP66 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HMG20AQ9NP66 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HMG20AQ9NP66 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HMG20AQ9NP66 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HMG20AQ9NP66 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HMG20AQ9NP66 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HMG20AQ9NP66 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HMG20AQ9NP66 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HMG20AQ9NP66 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HMG20AQ9NP66 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HMG20AQ9NP66 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HMG20AQ9NP66 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HMG20AQ9NP66 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HMG20AQ9NP66 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HMG20AQ9NP66 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HMG20AQ9NP66 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HMG20AQ9NP66 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HMG20AQ9NP66 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HMG20AQ9NP66 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HMG20AQ9NP66 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HMG20AQ9NP66 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HMG20AQ9NP66 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HMG20AQ9NP66 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HMG20AQ9NP66 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HMG20AQ9NP66 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HMG20AQ9NP66 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HMG20AQ9NP66 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HMG20AQ9NP66 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HMG20AQ9NP66 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HMG20AQ9NP66 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HMG20AQ9NP66 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HMG20AQ9NP66 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HMG20AQ9NP66 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HMG20AQ9NP66 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HMG20AQ9NP66 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HMG20AQ9NP66 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HMG20AQ9NP66 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HMG20AQ9NP66 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HMG20AQ9NP66 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
HMG20AQ9NP66 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
HMG20AQ9NP66 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HMG20AQ9NP66 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HMG20AQ9NP66 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HMG20AQ9NP66 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HMG20AQ9NP66 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HMG20AQ9NP66 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HMG20AQ9NP66 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HMG20AQ9NP66 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HMG20AQ9NP66 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HMG20AQ9NP66 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HMG20AQ9NP66 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
HMG20AQ9NP66 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HMG20AQ9NP66 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HMG20AQ9NP66 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HMG20AQ9NP66 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HMG20AQ9NP66 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HMG20AQ9NP66 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms