Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM2

PLXNA4, Plexin-A4, humanhuman

Predictions only

Length 1,894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNA4Q9HCM2 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PLXNA4Q9HCM2 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PLXNA4Q9HCM2 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PLXNA4Q9HCM2 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PLXNA4Q9HCM2 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PLXNA4Q9HCM2 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PLXNA4Q9HCM2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PLXNA4Q9HCM2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PLXNA4Q9HCM2 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PLXNA4Q9HCM2 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PLXNA4Q9HCM2 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PLXNA4Q9HCM2 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PLXNA4Q9HCM2 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PLXNA4Q9HCM2 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PLXNA4Q9HCM2 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PLXNA4Q9HCM2 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PLXNA4Q9HCM2 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PLXNA4Q9HCM2 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PLXNA4Q9HCM2 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PLXNA4Q9HCM2 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PLXNA4Q9HCM2 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PLXNA4Q9HCM2 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PLXNA4Q9HCM2 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PLXNA4Q9HCM2 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PLXNA4Q9HCM2 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PLXNA4Q9HCM2 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PLXNA4Q9HCM2 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PLXNA4Q9HCM2 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PLXNA4Q9HCM2 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PLXNA4Q9HCM2 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PLXNA4Q9HCM2 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PLXNA4Q9HCM2 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PLXNA4Q9HCM2 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PLXNA4Q9HCM2 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PLXNA4Q9HCM2 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PLXNA4Q9HCM2 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PLXNA4Q9HCM2 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PLXNA4Q9HCM2 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PLXNA4Q9HCM2 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PLXNA4Q9HCM2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PLXNA4Q9HCM2 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PLXNA4Q9HCM2 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PLXNA4Q9HCM2 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PLXNA4Q9HCM2 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PLXNA4Q9HCM2 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PLXNA4Q9HCM2 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PLXNA4Q9HCM2 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PLXNA4Q9HCM2 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PLXNA4Q9HCM2 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PLXNA4Q9HCM2 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PLXNA4Q9HCM2 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PLXNA4Q9HCM2 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PLXNA4Q9HCM2 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PLXNA4Q9HCM2 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PLXNA4Q9HCM2 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PLXNA4Q9HCM2 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PLXNA4Q9HCM2 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PLXNA4Q9HCM2 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PLXNA4Q9HCM2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PLXNA4Q9HCM2 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PLXNA4Q9HCM2 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PLXNA4Q9HCM2 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PLXNA4Q9HCM2 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PLXNA4Q9HCM2 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PLXNA4Q9HCM2 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PLXNA4Q9HCM2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PLXNA4Q9HCM2 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PLXNA4Q9HCM2 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PLXNA4Q9HCM2 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PLXNA4Q9HCM2 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PLXNA4Q9HCM2 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PLXNA4Q9HCM2 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PLXNA4Q9HCM2 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PLXNA4Q9HCM2 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PLXNA4Q9HCM2 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PLXNA4Q9HCM2 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PLXNA4Q9HCM2 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PLXNA4Q9HCM2 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PLXNA4Q9HCM2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PLXNA4Q9HCM2 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PLXNA4Q9HCM2 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PLXNA4Q9HCM2 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PLXNA4Q9HCM2 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PLXNA4Q9HCM2 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PLXNA4Q9HCM2 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PLXNA4Q9HCM2 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PLXNA4Q9HCM2 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PLXNA4Q9HCM2 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PLXNA4Q9HCM2 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PLXNA4Q9HCM2 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PLXNA4Q9HCM2 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PLXNA4Q9HCM2 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PLXNA4Q9HCM2 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PLXNA4Q9HCM2 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PLXNA4Q9HCM2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PLXNA4Q9HCM2 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PLXNA4Q9HCM2 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PLXNA4Q9HCM2 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PLXNA4Q9HCM2 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PLXNA4Q9HCM2 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms