Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCJ6

VAT1L, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog-like, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1LQ9HCJ6 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
VAT1LQ9HCJ6 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
VAT1LQ9HCJ6 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.8
VAT1LQ9HCJ6 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
VAT1LQ9HCJ6 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
VAT1LQ9HCJ6 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
VAT1LQ9HCJ6 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
VAT1LQ9HCJ6 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
VAT1LQ9HCJ6 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
VAT1LQ9HCJ6 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
VAT1LQ9HCJ6 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
VAT1LQ9HCJ6 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
VAT1LQ9HCJ6 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
VAT1LQ9HCJ6 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
VAT1LQ9HCJ6 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
VAT1LQ9HCJ6 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
VAT1LQ9HCJ6 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
VAT1LQ9HCJ6 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
VAT1LQ9HCJ6 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
VAT1LQ9HCJ6 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
VAT1LQ9HCJ6 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
VAT1LQ9HCJ6 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC26.3■■□□□ 1.8
VAT1LQ9HCJ6 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
VAT1LQ9HCJ6 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
VAT1LQ9HCJ6 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
VAT1LQ9HCJ6 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
VAT1LQ9HCJ6 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
VAT1LQ9HCJ6 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
VAT1LQ9HCJ6 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
VAT1LQ9HCJ6 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
VAT1LQ9HCJ6 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
VAT1LQ9HCJ6 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
VAT1LQ9HCJ6 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
VAT1LQ9HCJ6 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
VAT1LQ9HCJ6 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
VAT1LQ9HCJ6 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
VAT1LQ9HCJ6 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
VAT1LQ9HCJ6 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
VAT1LQ9HCJ6 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
VAT1LQ9HCJ6 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
VAT1LQ9HCJ6 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
VAT1LQ9HCJ6 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
VAT1LQ9HCJ6 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
VAT1LQ9HCJ6 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
VAT1LQ9HCJ6 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
VAT1LQ9HCJ6 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
VAT1LQ9HCJ6 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
VAT1LQ9HCJ6 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
VAT1LQ9HCJ6 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
VAT1LQ9HCJ6 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
VAT1LQ9HCJ6 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
VAT1LQ9HCJ6 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
VAT1LQ9HCJ6 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
VAT1LQ9HCJ6 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
VAT1LQ9HCJ6 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
VAT1LQ9HCJ6 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
VAT1LQ9HCJ6 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
VAT1LQ9HCJ6 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
VAT1LQ9HCJ6 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
VAT1LQ9HCJ6 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
VAT1LQ9HCJ6 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
VAT1LQ9HCJ6 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
VAT1LQ9HCJ6 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
VAT1LQ9HCJ6 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
VAT1LQ9HCJ6 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
VAT1LQ9HCJ6 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
VAT1LQ9HCJ6 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
VAT1LQ9HCJ6 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
VAT1LQ9HCJ6 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
VAT1LQ9HCJ6 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
VAT1LQ9HCJ6 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
VAT1LQ9HCJ6 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
VAT1LQ9HCJ6 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
VAT1LQ9HCJ6 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
VAT1LQ9HCJ6 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
VAT1LQ9HCJ6 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
VAT1LQ9HCJ6 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
VAT1LQ9HCJ6 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
VAT1LQ9HCJ6 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
VAT1LQ9HCJ6 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
VAT1LQ9HCJ6 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
VAT1LQ9HCJ6 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
VAT1LQ9HCJ6 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
VAT1LQ9HCJ6 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
VAT1LQ9HCJ6 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
VAT1LQ9HCJ6 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
VAT1LQ9HCJ6 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
VAT1LQ9HCJ6 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
VAT1LQ9HCJ6 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
VAT1LQ9HCJ6 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
VAT1LQ9HCJ6 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
VAT1LQ9HCJ6 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
VAT1LQ9HCJ6 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
VAT1LQ9HCJ6 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
VAT1LQ9HCJ6 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
VAT1LQ9HCJ6 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
VAT1LQ9HCJ6 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
VAT1LQ9HCJ6 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
VAT1LQ9HCJ6 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
VAT1LQ9HCJ6 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms