Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC56

PCDH9, Protocadherin-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH9Q9HC56 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDH9Q9HC56 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDH9Q9HC56 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDH9Q9HC56 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDH9Q9HC56 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDH9Q9HC56 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDH9Q9HC56 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDH9Q9HC56 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDH9Q9HC56 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDH9Q9HC56 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDH9Q9HC56 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDH9Q9HC56 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDH9Q9HC56 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDH9Q9HC56 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDH9Q9HC56 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDH9Q9HC56 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDH9Q9HC56 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDH9Q9HC56 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDH9Q9HC56 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDH9Q9HC56 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDH9Q9HC56 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDH9Q9HC56 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDH9Q9HC56 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDH9Q9HC56 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDH9Q9HC56 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDH9Q9HC56 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDH9Q9HC56 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDH9Q9HC56 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDH9Q9HC56 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDH9Q9HC56 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDH9Q9HC56 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDH9Q9HC56 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDH9Q9HC56 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDH9Q9HC56 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDH9Q9HC56 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDH9Q9HC56 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDH9Q9HC56 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDH9Q9HC56 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDH9Q9HC56 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PCDH9Q9HC56 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCDH9Q9HC56 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCDH9Q9HC56 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCDH9Q9HC56 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCDH9Q9HC56 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCDH9Q9HC56 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCDH9Q9HC56 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PCDH9Q9HC56 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PCDH9Q9HC56 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCDH9Q9HC56 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCDH9Q9HC56 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCDH9Q9HC56 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCDH9Q9HC56 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCDH9Q9HC56 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCDH9Q9HC56 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCDH9Q9HC56 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCDH9Q9HC56 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCDH9Q9HC56 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PCDH9Q9HC56 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCDH9Q9HC56 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCDH9Q9HC56 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCDH9Q9HC56 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCDH9Q9HC56 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PCDH9Q9HC56 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCDH9Q9HC56 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCDH9Q9HC56 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCDH9Q9HC56 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCDH9Q9HC56 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCDH9Q9HC56 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCDH9Q9HC56 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCDH9Q9HC56 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCDH9Q9HC56 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCDH9Q9HC56 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCDH9Q9HC56 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCDH9Q9HC56 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCDH9Q9HC56 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCDH9Q9HC56 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCDH9Q9HC56 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCDH9Q9HC56 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCDH9Q9HC56 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PCDH9Q9HC56 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCDH9Q9HC56 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCDH9Q9HC56 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCDH9Q9HC56 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCDH9Q9HC56 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCDH9Q9HC56 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCDH9Q9HC56 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCDH9Q9HC56 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCDH9Q9HC56 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCDH9Q9HC56 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCDH9Q9HC56 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCDH9Q9HC56 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCDH9Q9HC56 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCDH9Q9HC56 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCDH9Q9HC56 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCDH9Q9HC56 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCDH9Q9HC56 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCDH9Q9HC56 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCDH9Q9HC56 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCDH9Q9HC56 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCDH9Q9HC56 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms