Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBG7

LY9, T-lymphocyte surface antigen Ly-9, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LY9Q9HBG7 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LY9Q9HBG7 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LY9Q9HBG7 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LY9Q9HBG7 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LY9Q9HBG7 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LY9Q9HBG7 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LY9Q9HBG7 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LY9Q9HBG7 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LY9Q9HBG7 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LY9Q9HBG7 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LY9Q9HBG7 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LY9Q9HBG7 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LY9Q9HBG7 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LY9Q9HBG7 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LY9Q9HBG7 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LY9Q9HBG7 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LY9Q9HBG7 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LY9Q9HBG7 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LY9Q9HBG7 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LY9Q9HBG7 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LY9Q9HBG7 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LY9Q9HBG7 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LY9Q9HBG7 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LY9Q9HBG7 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LY9Q9HBG7 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LY9Q9HBG7 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LY9Q9HBG7 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LY9Q9HBG7 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LY9Q9HBG7 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LY9Q9HBG7 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LY9Q9HBG7 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LY9Q9HBG7 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LY9Q9HBG7 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LY9Q9HBG7 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LY9Q9HBG7 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LY9Q9HBG7 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LY9Q9HBG7 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LY9Q9HBG7 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LY9Q9HBG7 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LY9Q9HBG7 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LY9Q9HBG7 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LY9Q9HBG7 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LY9Q9HBG7 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LY9Q9HBG7 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
LY9Q9HBG7 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LY9Q9HBG7 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.84
LY9Q9HBG7 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
LY9Q9HBG7 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LY9Q9HBG7 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LY9Q9HBG7 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LY9Q9HBG7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LY9Q9HBG7 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LY9Q9HBG7 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LY9Q9HBG7 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LY9Q9HBG7 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LY9Q9HBG7 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LY9Q9HBG7 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LY9Q9HBG7 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LY9Q9HBG7 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LY9Q9HBG7 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LY9Q9HBG7 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LY9Q9HBG7 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LY9Q9HBG7 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LY9Q9HBG7 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LY9Q9HBG7 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LY9Q9HBG7 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LY9Q9HBG7 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LY9Q9HBG7 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LY9Q9HBG7 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LY9Q9HBG7 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LY9Q9HBG7 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LY9Q9HBG7 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LY9Q9HBG7 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
LY9Q9HBG7 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LY9Q9HBG7 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LY9Q9HBG7 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LY9Q9HBG7 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LY9Q9HBG7 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LY9Q9HBG7 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LY9Q9HBG7 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LY9Q9HBG7 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LY9Q9HBG7 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LY9Q9HBG7 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
LY9Q9HBG7 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LY9Q9HBG7 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LY9Q9HBG7 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LY9Q9HBG7 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
LY9Q9HBG7 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
LY9Q9HBG7 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
LY9Q9HBG7 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
LY9Q9HBG7 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LY9Q9HBG7 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LY9Q9HBG7 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LY9Q9HBG7 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LY9Q9HBG7 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LY9Q9HBG7 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LY9Q9HBG7 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LY9Q9HBG7 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LY9Q9HBG7 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LY9Q9HBG7 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms