Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBA0

TRPV4, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 4, humanhuman

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPV4Q9HBA0 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRPV4Q9HBA0 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRPV4Q9HBA0 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRPV4Q9HBA0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRPV4Q9HBA0 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRPV4Q9HBA0 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRPV4Q9HBA0 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRPV4Q9HBA0 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRPV4Q9HBA0 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRPV4Q9HBA0 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TRPV4Q9HBA0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRPV4Q9HBA0 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRPV4Q9HBA0 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRPV4Q9HBA0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRPV4Q9HBA0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRPV4Q9HBA0 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRPV4Q9HBA0 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRPV4Q9HBA0 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRPV4Q9HBA0 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRPV4Q9HBA0 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TRPV4Q9HBA0 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRPV4Q9HBA0 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRPV4Q9HBA0 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRPV4Q9HBA0 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRPV4Q9HBA0 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRPV4Q9HBA0 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRPV4Q9HBA0 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRPV4Q9HBA0 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRPV4Q9HBA0 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TRPV4Q9HBA0 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TRPV4Q9HBA0 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TRPV4Q9HBA0 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRPV4Q9HBA0 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TRPV4Q9HBA0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRPV4Q9HBA0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRPV4Q9HBA0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRPV4Q9HBA0 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRPV4Q9HBA0 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRPV4Q9HBA0 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRPV4Q9HBA0 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TRPV4Q9HBA0 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRPV4Q9HBA0 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRPV4Q9HBA0 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRPV4Q9HBA0 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRPV4Q9HBA0 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRPV4Q9HBA0 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRPV4Q9HBA0 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRPV4Q9HBA0 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TRPV4Q9HBA0 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRPV4Q9HBA0 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRPV4Q9HBA0 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRPV4Q9HBA0 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRPV4Q9HBA0 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRPV4Q9HBA0 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRPV4Q9HBA0 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRPV4Q9HBA0 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRPV4Q9HBA0 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRPV4Q9HBA0 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRPV4Q9HBA0 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRPV4Q9HBA0 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRPV4Q9HBA0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRPV4Q9HBA0 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRPV4Q9HBA0 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRPV4Q9HBA0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRPV4Q9HBA0 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRPV4Q9HBA0 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRPV4Q9HBA0 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRPV4Q9HBA0 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRPV4Q9HBA0 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRPV4Q9HBA0 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRPV4Q9HBA0 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRPV4Q9HBA0 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRPV4Q9HBA0 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRPV4Q9HBA0 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRPV4Q9HBA0 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRPV4Q9HBA0 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRPV4Q9HBA0 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRPV4Q9HBA0 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRPV4Q9HBA0 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRPV4Q9HBA0 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRPV4Q9HBA0 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRPV4Q9HBA0 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRPV4Q9HBA0 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRPV4Q9HBA0 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRPV4Q9HBA0 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRPV4Q9HBA0 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRPV4Q9HBA0 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRPV4Q9HBA0 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRPV4Q9HBA0 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRPV4Q9HBA0 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRPV4Q9HBA0 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRPV4Q9HBA0 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRPV4Q9HBA0 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRPV4Q9HBA0 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRPV4Q9HBA0 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRPV4Q9HBA0 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRPV4Q9HBA0 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRPV4Q9HBA0 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TRPV4Q9HBA0 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRPV4Q9HBA0 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms