Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9E3

COG4, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG4Q9H9E3 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COG4Q9H9E3 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COG4Q9H9E3 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
COG4Q9H9E3 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COG4Q9H9E3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COG4Q9H9E3 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
COG4Q9H9E3 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
COG4Q9H9E3 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
COG4Q9H9E3 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COG4Q9H9E3 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COG4Q9H9E3 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COG4Q9H9E3 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COG4Q9H9E3 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COG4Q9H9E3 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COG4Q9H9E3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COG4Q9H9E3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COG4Q9H9E3 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COG4Q9H9E3 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COG4Q9H9E3 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COG4Q9H9E3 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COG4Q9H9E3 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COG4Q9H9E3 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
COG4Q9H9E3 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COG4Q9H9E3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COG4Q9H9E3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COG4Q9H9E3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COG4Q9H9E3 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COG4Q9H9E3 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COG4Q9H9E3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COG4Q9H9E3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COG4Q9H9E3 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COG4Q9H9E3 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COG4Q9H9E3 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COG4Q9H9E3 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COG4Q9H9E3 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COG4Q9H9E3 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COG4Q9H9E3 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COG4Q9H9E3 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COG4Q9H9E3 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
COG4Q9H9E3 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COG4Q9H9E3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COG4Q9H9E3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COG4Q9H9E3 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COG4Q9H9E3 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COG4Q9H9E3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COG4Q9H9E3 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COG4Q9H9E3 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COG4Q9H9E3 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COG4Q9H9E3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COG4Q9H9E3 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COG4Q9H9E3 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COG4Q9H9E3 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COG4Q9H9E3 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
COG4Q9H9E3 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COG4Q9H9E3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COG4Q9H9E3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
COG4Q9H9E3 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COG4Q9H9E3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COG4Q9H9E3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COG4Q9H9E3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COG4Q9H9E3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
COG4Q9H9E3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
COG4Q9H9E3 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COG4Q9H9E3 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COG4Q9H9E3 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
COG4Q9H9E3 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
COG4Q9H9E3 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COG4Q9H9E3 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
COG4Q9H9E3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
COG4Q9H9E3 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
COG4Q9H9E3 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
COG4Q9H9E3 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
COG4Q9H9E3 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
COG4Q9H9E3 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
COG4Q9H9E3 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
COG4Q9H9E3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
COG4Q9H9E3 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
COG4Q9H9E3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
COG4Q9H9E3 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COG4Q9H9E3 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
COG4Q9H9E3 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
COG4Q9H9E3 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
COG4Q9H9E3 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
COG4Q9H9E3 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
COG4Q9H9E3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COG4Q9H9E3 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
COG4Q9H9E3 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
COG4Q9H9E3 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COG4Q9H9E3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
COG4Q9H9E3 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COG4Q9H9E3 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
COG4Q9H9E3 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COG4Q9H9E3 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COG4Q9H9E3 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
COG4Q9H9E3 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COG4Q9H9E3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COG4Q9H9E3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COG4Q9H9E3 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
COG4Q9H9E3 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
COG4Q9H9E3 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms