Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7V2

SYNDIG1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNDIG1Q9H7V2 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYNDIG1Q9H7V2 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYNDIG1Q9H7V2 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYNDIG1Q9H7V2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYNDIG1Q9H7V2 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYNDIG1Q9H7V2 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYNDIG1Q9H7V2 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SYNDIG1Q9H7V2 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYNDIG1Q9H7V2 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SYNDIG1Q9H7V2 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SYNDIG1Q9H7V2 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SYNDIG1Q9H7V2 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SYNDIG1Q9H7V2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYNDIG1Q9H7V2 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYNDIG1Q9H7V2 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYNDIG1Q9H7V2 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SYNDIG1Q9H7V2 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYNDIG1Q9H7V2 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYNDIG1Q9H7V2 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYNDIG1Q9H7V2 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SYNDIG1Q9H7V2 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYNDIG1Q9H7V2 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYNDIG1Q9H7V2 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYNDIG1Q9H7V2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SYNDIG1Q9H7V2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYNDIG1Q9H7V2 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SYNDIG1Q9H7V2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYNDIG1Q9H7V2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYNDIG1Q9H7V2 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYNDIG1Q9H7V2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYNDIG1Q9H7V2 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYNDIG1Q9H7V2 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYNDIG1Q9H7V2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYNDIG1Q9H7V2 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYNDIG1Q9H7V2 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYNDIG1Q9H7V2 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYNDIG1Q9H7V2 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYNDIG1Q9H7V2 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYNDIG1Q9H7V2 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SYNDIG1Q9H7V2 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYNDIG1Q9H7V2 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYNDIG1Q9H7V2 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SYNDIG1Q9H7V2 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYNDIG1Q9H7V2 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SYNDIG1Q9H7V2 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYNDIG1Q9H7V2 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYNDIG1Q9H7V2 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYNDIG1Q9H7V2 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYNDIG1Q9H7V2 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYNDIG1Q9H7V2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYNDIG1Q9H7V2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYNDIG1Q9H7V2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYNDIG1Q9H7V2 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYNDIG1Q9H7V2 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYNDIG1Q9H7V2 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYNDIG1Q9H7V2 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYNDIG1Q9H7V2 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYNDIG1Q9H7V2 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYNDIG1Q9H7V2 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYNDIG1Q9H7V2 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYNDIG1Q9H7V2 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYNDIG1Q9H7V2 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYNDIG1Q9H7V2 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYNDIG1Q9H7V2 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYNDIG1Q9H7V2 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYNDIG1Q9H7V2 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYNDIG1Q9H7V2 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYNDIG1Q9H7V2 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SYNDIG1Q9H7V2 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYNDIG1Q9H7V2 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYNDIG1Q9H7V2 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYNDIG1Q9H7V2 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYNDIG1Q9H7V2 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYNDIG1Q9H7V2 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYNDIG1Q9H7V2 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYNDIG1Q9H7V2 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYNDIG1Q9H7V2 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SYNDIG1Q9H7V2 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYNDIG1Q9H7V2 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYNDIG1Q9H7V2 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYNDIG1Q9H7V2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYNDIG1Q9H7V2 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYNDIG1Q9H7V2 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYNDIG1Q9H7V2 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYNDIG1Q9H7V2 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYNDIG1Q9H7V2 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYNDIG1Q9H7V2 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SYNDIG1Q9H7V2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYNDIG1Q9H7V2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYNDIG1Q9H7V2 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYNDIG1Q9H7V2 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SYNDIG1Q9H7V2 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SYNDIG1Q9H7V2 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SYNDIG1Q9H7V2 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SYNDIG1Q9H7V2 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SYNDIG1Q9H7V2 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SYNDIG1Q9H7V2 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SYNDIG1Q9H7V2 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SYNDIG1Q9H7V2 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SYNDIG1Q9H7V2 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms