Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6B4

CLMP, CXADR-like membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMPQ9H6B4 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLMPQ9H6B4 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLMPQ9H6B4 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CLMPQ9H6B4 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CLMPQ9H6B4 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CLMPQ9H6B4 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLMPQ9H6B4 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLMPQ9H6B4 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CLMPQ9H6B4 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLMPQ9H6B4 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLMPQ9H6B4 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLMPQ9H6B4 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLMPQ9H6B4 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLMPQ9H6B4 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLMPQ9H6B4 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLMPQ9H6B4 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLMPQ9H6B4 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLMPQ9H6B4 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLMPQ9H6B4 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLMPQ9H6B4 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLMPQ9H6B4 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLMPQ9H6B4 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CLMPQ9H6B4 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLMPQ9H6B4 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLMPQ9H6B4 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLMPQ9H6B4 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLMPQ9H6B4 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CLMPQ9H6B4 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLMPQ9H6B4 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLMPQ9H6B4 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLMPQ9H6B4 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLMPQ9H6B4 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLMPQ9H6B4 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLMPQ9H6B4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLMPQ9H6B4 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLMPQ9H6B4 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLMPQ9H6B4 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLMPQ9H6B4 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLMPQ9H6B4 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLMPQ9H6B4 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLMPQ9H6B4 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLMPQ9H6B4 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLMPQ9H6B4 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLMPQ9H6B4 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLMPQ9H6B4 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
CLMPQ9H6B4 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLMPQ9H6B4 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLMPQ9H6B4 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLMPQ9H6B4 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLMPQ9H6B4 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLMPQ9H6B4 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLMPQ9H6B4 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CLMPQ9H6B4 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLMPQ9H6B4 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLMPQ9H6B4 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLMPQ9H6B4 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLMPQ9H6B4 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLMPQ9H6B4 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLMPQ9H6B4 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLMPQ9H6B4 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLMPQ9H6B4 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLMPQ9H6B4 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLMPQ9H6B4 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLMPQ9H6B4 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLMPQ9H6B4 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLMPQ9H6B4 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLMPQ9H6B4 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLMPQ9H6B4 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CLMPQ9H6B4 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLMPQ9H6B4 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLMPQ9H6B4 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLMPQ9H6B4 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLMPQ9H6B4 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLMPQ9H6B4 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLMPQ9H6B4 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLMPQ9H6B4 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLMPQ9H6B4 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLMPQ9H6B4 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CLMPQ9H6B4 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLMPQ9H6B4 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLMPQ9H6B4 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLMPQ9H6B4 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLMPQ9H6B4 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLMPQ9H6B4 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLMPQ9H6B4 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLMPQ9H6B4 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLMPQ9H6B4 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLMPQ9H6B4 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLMPQ9H6B4 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLMPQ9H6B4 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLMPQ9H6B4 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLMPQ9H6B4 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLMPQ9H6B4 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLMPQ9H6B4 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLMPQ9H6B4 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLMPQ9H6B4 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLMPQ9H6B4 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLMPQ9H6B4 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLMPQ9H6B4 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLMPQ9H6B4 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73 ms