Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4E5

RHOJ, Rho-related GTP-binding protein RhoJ, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOJQ9H4E5 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RHOJQ9H4E5 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RHOJQ9H4E5 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RHOJQ9H4E5 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RHOJQ9H4E5 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RHOJQ9H4E5 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RHOJQ9H4E5 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RHOJQ9H4E5 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RHOJQ9H4E5 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RHOJQ9H4E5 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RHOJQ9H4E5 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RHOJQ9H4E5 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RHOJQ9H4E5 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RHOJQ9H4E5 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RHOJQ9H4E5 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RHOJQ9H4E5 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RHOJQ9H4E5 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RHOJQ9H4E5 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RHOJQ9H4E5 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RHOJQ9H4E5 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RHOJQ9H4E5 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RHOJQ9H4E5 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RHOJQ9H4E5 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RHOJQ9H4E5 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RHOJQ9H4E5 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RHOJQ9H4E5 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RHOJQ9H4E5 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RHOJQ9H4E5 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RHOJQ9H4E5 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RHOJQ9H4E5 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RHOJQ9H4E5 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RHOJQ9H4E5 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RHOJQ9H4E5 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RHOJQ9H4E5 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RHOJQ9H4E5 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RHOJQ9H4E5 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RHOJQ9H4E5 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RHOJQ9H4E5 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RHOJQ9H4E5 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RHOJQ9H4E5 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RHOJQ9H4E5 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RHOJQ9H4E5 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RHOJQ9H4E5 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RHOJQ9H4E5 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RHOJQ9H4E5 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RHOJQ9H4E5 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RHOJQ9H4E5 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RHOJQ9H4E5 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RHOJQ9H4E5 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
RHOJQ9H4E5 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RHOJQ9H4E5 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
RHOJQ9H4E5 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
RHOJQ9H4E5 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RHOJQ9H4E5 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RHOJQ9H4E5 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RHOJQ9H4E5 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RHOJQ9H4E5 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RHOJQ9H4E5 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RHOJQ9H4E5 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RHOJQ9H4E5 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RHOJQ9H4E5 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RHOJQ9H4E5 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RHOJQ9H4E5 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RHOJQ9H4E5 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RHOJQ9H4E5 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RHOJQ9H4E5 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RHOJQ9H4E5 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RHOJQ9H4E5 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RHOJQ9H4E5 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RHOJQ9H4E5 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RHOJQ9H4E5 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RHOJQ9H4E5 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RHOJQ9H4E5 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RHOJQ9H4E5 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RHOJQ9H4E5 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RHOJQ9H4E5 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RHOJQ9H4E5 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RHOJQ9H4E5 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RHOJQ9H4E5 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RHOJQ9H4E5 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RHOJQ9H4E5 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RHOJQ9H4E5 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RHOJQ9H4E5 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RHOJQ9H4E5 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RHOJQ9H4E5 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RHOJQ9H4E5 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RHOJQ9H4E5 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RHOJQ9H4E5 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RHOJQ9H4E5 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RHOJQ9H4E5 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RHOJQ9H4E5 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RHOJQ9H4E5 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RHOJQ9H4E5 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RHOJQ9H4E5 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RHOJQ9H4E5 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RHOJQ9H4E5 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RHOJQ9H4E5 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RHOJQ9H4E5 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RHOJQ9H4E5 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RHOJQ9H4E5 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms