Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0W5

CCDC8, Coiled-coil domain-containing protein 8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC8Q9H0W5 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CCDC8Q9H0W5 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC8Q9H0W5 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC8Q9H0W5 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC8Q9H0W5 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC8Q9H0W5 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC8Q9H0W5 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC8Q9H0W5 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC8Q9H0W5 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC8Q9H0W5 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC8Q9H0W5 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC8Q9H0W5 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC8Q9H0W5 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC8Q9H0W5 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC8Q9H0W5 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC8Q9H0W5 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC8Q9H0W5 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC8Q9H0W5 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC8Q9H0W5 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC8Q9H0W5 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC8Q9H0W5 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC8Q9H0W5 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC8Q9H0W5 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC8Q9H0W5 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC8Q9H0W5 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC8Q9H0W5 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC8Q9H0W5 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC8Q9H0W5 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC8Q9H0W5 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC8Q9H0W5 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC8Q9H0W5 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC8Q9H0W5 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC8Q9H0W5 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC8Q9H0W5 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC8Q9H0W5 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC8Q9H0W5 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC8Q9H0W5 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC8Q9H0W5 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC8Q9H0W5 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC8Q9H0W5 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC8Q9H0W5 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC8Q9H0W5 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC8Q9H0W5 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC8Q9H0W5 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC8Q9H0W5 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC8Q9H0W5 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC8Q9H0W5 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC8Q9H0W5 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
CCDC8Q9H0W5 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
CCDC8Q9H0W5 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC8Q9H0W5 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC8Q9H0W5 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC8Q9H0W5 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC8Q9H0W5 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC8Q9H0W5 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC8Q9H0W5 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC8Q9H0W5 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC8Q9H0W5 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC8Q9H0W5 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC8Q9H0W5 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC8Q9H0W5 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC8Q9H0W5 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC8Q9H0W5 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC8Q9H0W5 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC8Q9H0W5 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC8Q9H0W5 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC8Q9H0W5 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC8Q9H0W5 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC8Q9H0W5 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC8Q9H0W5 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC8Q9H0W5 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC8Q9H0W5 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC8Q9H0W5 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC8Q9H0W5 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC8Q9H0W5 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC8Q9H0W5 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC8Q9H0W5 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC8Q9H0W5 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC8Q9H0W5 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC8Q9H0W5 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC8Q9H0W5 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC8Q9H0W5 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC8Q9H0W5 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC8Q9H0W5 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC8Q9H0W5 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC8Q9H0W5 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC8Q9H0W5 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC8Q9H0W5 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC8Q9H0W5 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC8Q9H0W5 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC8Q9H0W5 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC8Q9H0W5 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC8Q9H0W5 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC8Q9H0W5 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC8Q9H0W5 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC8Q9H0W5 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
CCDC8Q9H0W5 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
CCDC8Q9H0W5 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
CCDC8Q9H0W5 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
CCDC8Q9H0W5 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms