Protein–RNA interactions for Protein: Q9H015

SLC22A4, Solute carrier family 22 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC22A4Q9H015 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC22A4Q9H015 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC22A4Q9H015 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC22A4Q9H015 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC22A4Q9H015 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC22A4Q9H015 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC22A4Q9H015 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC22A4Q9H015 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC22A4Q9H015 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC22A4Q9H015 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC22A4Q9H015 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC22A4Q9H015 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC22A4Q9H015 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC22A4Q9H015 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC22A4Q9H015 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC22A4Q9H015 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC22A4Q9H015 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC22A4Q9H015 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC22A4Q9H015 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC22A4Q9H015 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC22A4Q9H015 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC22A4Q9H015 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC22A4Q9H015 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC22A4Q9H015 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC22A4Q9H015 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC22A4Q9H015 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC22A4Q9H015 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC22A4Q9H015 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC22A4Q9H015 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC22A4Q9H015 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC22A4Q9H015 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC22A4Q9H015 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC22A4Q9H015 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC22A4Q9H015 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC22A4Q9H015 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC22A4Q9H015 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC22A4Q9H015 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC22A4Q9H015 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC22A4Q9H015 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC22A4Q9H015 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC22A4Q9H015 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC22A4Q9H015 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC22A4Q9H015 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC22A4Q9H015 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC22A4Q9H015 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC22A4Q9H015 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC22A4Q9H015 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC22A4Q9H015 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC22A4Q9H015 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC22A4Q9H015 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC22A4Q9H015 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC22A4Q9H015 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC22A4Q9H015 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC22A4Q9H015 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC22A4Q9H015 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC22A4Q9H015 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC22A4Q9H015 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC22A4Q9H015 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC22A4Q9H015 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC22A4Q9H015 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC22A4Q9H015 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC22A4Q9H015 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC22A4Q9H015 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC22A4Q9H015 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC22A4Q9H015 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC22A4Q9H015 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC22A4Q9H015 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC22A4Q9H015 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC22A4Q9H015 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC22A4Q9H015 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC22A4Q9H015 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC22A4Q9H015 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC22A4Q9H015 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC22A4Q9H015 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC22A4Q9H015 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC22A4Q9H015 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC22A4Q9H015 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC22A4Q9H015 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC22A4Q9H015 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC22A4Q9H015 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC22A4Q9H015 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC22A4Q9H015 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC22A4Q9H015 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC22A4Q9H015 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC22A4Q9H015 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC22A4Q9H015 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC22A4Q9H015 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC22A4Q9H015 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC22A4Q9H015 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC22A4Q9H015 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC22A4Q9H015 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC22A4Q9H015 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC22A4Q9H015 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC22A4Q9H015 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC22A4Q9H015 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC22A4Q9H015 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC22A4Q9H015 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC22A4Q9H015 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC22A4Q9H015 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC22A4Q9H015 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms