Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0B6

BRINP2, BMP/retinoic acid-inducible neural-specific protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRINP2Q9C0B6 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BRINP2Q9C0B6 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
BRINP2Q9C0B6 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
BRINP2Q9C0B6 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
BRINP2Q9C0B6 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
BRINP2Q9C0B6 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
BRINP2Q9C0B6 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BRINP2Q9C0B6 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
BRINP2Q9C0B6 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BRINP2Q9C0B6 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BRINP2Q9C0B6 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BRINP2Q9C0B6 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BRINP2Q9C0B6 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BRINP2Q9C0B6 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BRINP2Q9C0B6 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BRINP2Q9C0B6 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BRINP2Q9C0B6 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BRINP2Q9C0B6 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BRINP2Q9C0B6 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BRINP2Q9C0B6 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BRINP2Q9C0B6 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
BRINP2Q9C0B6 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRINP2Q9C0B6 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRINP2Q9C0B6 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRINP2Q9C0B6 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRINP2Q9C0B6 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRINP2Q9C0B6 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRINP2Q9C0B6 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRINP2Q9C0B6 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRINP2Q9C0B6 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRINP2Q9C0B6 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRINP2Q9C0B6 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRINP2Q9C0B6 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRINP2Q9C0B6 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRINP2Q9C0B6 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRINP2Q9C0B6 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRINP2Q9C0B6 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRINP2Q9C0B6 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRINP2Q9C0B6 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRINP2Q9C0B6 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRINP2Q9C0B6 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRINP2Q9C0B6 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRINP2Q9C0B6 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRINP2Q9C0B6 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRINP2Q9C0B6 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
BRINP2Q9C0B6 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRINP2Q9C0B6 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRINP2Q9C0B6 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
BRINP2Q9C0B6 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRINP2Q9C0B6 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRINP2Q9C0B6 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRINP2Q9C0B6 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRINP2Q9C0B6 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BRINP2Q9C0B6 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BRINP2Q9C0B6 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BRINP2Q9C0B6 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BRINP2Q9C0B6 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
BRINP2Q9C0B6 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BRINP2Q9C0B6 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BRINP2Q9C0B6 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
BRINP2Q9C0B6 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
BRINP2Q9C0B6 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
BRINP2Q9C0B6 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BRINP2Q9C0B6 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BRINP2Q9C0B6 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BRINP2Q9C0B6 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BRINP2Q9C0B6 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BRINP2Q9C0B6 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BRINP2Q9C0B6 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BRINP2Q9C0B6 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BRINP2Q9C0B6 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
BRINP2Q9C0B6 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BRINP2Q9C0B6 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BRINP2Q9C0B6 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BRINP2Q9C0B6 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BRINP2Q9C0B6 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BRINP2Q9C0B6 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BRINP2Q9C0B6 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BRINP2Q9C0B6 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BRINP2Q9C0B6 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BRINP2Q9C0B6 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BRINP2Q9C0B6 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BRINP2Q9C0B6 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BRINP2Q9C0B6 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BRINP2Q9C0B6 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BRINP2Q9C0B6 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
BRINP2Q9C0B6 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BRINP2Q9C0B6 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BRINP2Q9C0B6 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BRINP2Q9C0B6 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BRINP2Q9C0B6 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BRINP2Q9C0B6 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BRINP2Q9C0B6 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BRINP2Q9C0B6 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BRINP2Q9C0B6 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BRINP2Q9C0B6 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
BRINP2Q9C0B6 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
BRINP2Q9C0B6 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BRINP2Q9C0B6 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BRINP2Q9C0B6 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms