Protein–RNA interactions for Protein: Q9C037

TRIM4, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM4, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM4Q9C037 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM4Q9C037 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM4Q9C037 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM4Q9C037 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM4Q9C037 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM4Q9C037 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRIM4Q9C037 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRIM4Q9C037 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM4Q9C037 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM4Q9C037 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM4Q9C037 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM4Q9C037 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM4Q9C037 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM4Q9C037 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM4Q9C037 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM4Q9C037 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM4Q9C037 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM4Q9C037 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM4Q9C037 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM4Q9C037 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM4Q9C037 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM4Q9C037 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM4Q9C037 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM4Q9C037 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM4Q9C037 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM4Q9C037 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM4Q9C037 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM4Q9C037 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM4Q9C037 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM4Q9C037 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM4Q9C037 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM4Q9C037 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM4Q9C037 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM4Q9C037 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM4Q9C037 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM4Q9C037 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM4Q9C037 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM4Q9C037 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM4Q9C037 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM4Q9C037 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM4Q9C037 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM4Q9C037 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM4Q9C037 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM4Q9C037 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM4Q9C037 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM4Q9C037 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM4Q9C037 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM4Q9C037 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM4Q9C037 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM4Q9C037 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM4Q9C037 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM4Q9C037 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM4Q9C037 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM4Q9C037 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM4Q9C037 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM4Q9C037 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM4Q9C037 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM4Q9C037 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM4Q9C037 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM4Q9C037 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM4Q9C037 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM4Q9C037 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM4Q9C037 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM4Q9C037 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM4Q9C037 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM4Q9C037 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM4Q9C037 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM4Q9C037 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM4Q9C037 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM4Q9C037 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM4Q9C037 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM4Q9C037 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM4Q9C037 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM4Q9C037 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM4Q9C037 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM4Q9C037 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM4Q9C037 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM4Q9C037 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM4Q9C037 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM4Q9C037 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM4Q9C037 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM4Q9C037 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM4Q9C037 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM4Q9C037 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM4Q9C037 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM4Q9C037 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM4Q9C037 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM4Q9C037 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM4Q9C037 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM4Q9C037 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM4Q9C037 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM4Q9C037 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM4Q9C037 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM4Q9C037 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM4Q9C037 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM4Q9C037 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM4Q9C037 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM4Q9C037 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM4Q9C037 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM4Q9C037 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms