Protein–RNA interactions for Protein: Q9C035

TRIM5, Tripartite motif-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM5Q9C035 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM5Q9C035 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM5Q9C035 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM5Q9C035 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM5Q9C035 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM5Q9C035 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM5Q9C035 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM5Q9C035 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM5Q9C035 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM5Q9C035 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM5Q9C035 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM5Q9C035 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM5Q9C035 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM5Q9C035 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM5Q9C035 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM5Q9C035 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM5Q9C035 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM5Q9C035 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM5Q9C035 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM5Q9C035 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM5Q9C035 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM5Q9C035 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM5Q9C035 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM5Q9C035 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM5Q9C035 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM5Q9C035 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM5Q9C035 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM5Q9C035 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM5Q9C035 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM5Q9C035 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM5Q9C035 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM5Q9C035 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM5Q9C035 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM5Q9C035 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM5Q9C035 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM5Q9C035 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM5Q9C035 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM5Q9C035 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM5Q9C035 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM5Q9C035 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM5Q9C035 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM5Q9C035 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM5Q9C035 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM5Q9C035 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM5Q9C035 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM5Q9C035 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM5Q9C035 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM5Q9C035 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM5Q9C035 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM5Q9C035 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM5Q9C035 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM5Q9C035 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM5Q9C035 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM5Q9C035 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM5Q9C035 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM5Q9C035 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM5Q9C035 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM5Q9C035 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM5Q9C035 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM5Q9C035 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM5Q9C035 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM5Q9C035 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM5Q9C035 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM5Q9C035 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM5Q9C035 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM5Q9C035 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM5Q9C035 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM5Q9C035 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM5Q9C035 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
TRIM5Q9C035 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
TRIM5Q9C035 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM5Q9C035 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM5Q9C035 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM5Q9C035 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM5Q9C035 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM5Q9C035 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM5Q9C035 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM5Q9C035 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM5Q9C035 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM5Q9C035 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM5Q9C035 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM5Q9C035 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM5Q9C035 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM5Q9C035 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM5Q9C035 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM5Q9C035 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM5Q9C035 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM5Q9C035 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM5Q9C035 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM5Q9C035 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM5Q9C035 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM5Q9C035 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM5Q9C035 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM5Q9C035 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM5Q9C035 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM5Q9C035 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM5Q9C035 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM5Q9C035 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM5Q9C035 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM5Q9C035 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms