Protein–RNA interactions for Protein: Q9C030

TRIM6, Tripartite motif-containing protein 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM6Q9C030 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM6Q9C030 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM6Q9C030 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM6Q9C030 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM6Q9C030 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM6Q9C030 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM6Q9C030 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIM6Q9C030 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIM6Q9C030 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIM6Q9C030 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIM6Q9C030 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIM6Q9C030 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIM6Q9C030 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIM6Q9C030 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIM6Q9C030 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIM6Q9C030 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIM6Q9C030 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIM6Q9C030 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIM6Q9C030 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TRIM6Q9C030 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM6Q9C030 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM6Q9C030 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM6Q9C030 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM6Q9C030 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM6Q9C030 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM6Q9C030 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM6Q9C030 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM6Q9C030 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM6Q9C030 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM6Q9C030 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM6Q9C030 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM6Q9C030 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM6Q9C030 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM6Q9C030 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM6Q9C030 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM6Q9C030 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM6Q9C030 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM6Q9C030 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM6Q9C030 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM6Q9C030 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM6Q9C030 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM6Q9C030 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM6Q9C030 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM6Q9C030 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM6Q9C030 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM6Q9C030 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM6Q9C030 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM6Q9C030 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM6Q9C030 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM6Q9C030 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM6Q9C030 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM6Q9C030 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM6Q9C030 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM6Q9C030 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM6Q9C030 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM6Q9C030 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM6Q9C030 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM6Q9C030 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM6Q9C030 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM6Q9C030 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM6Q9C030 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM6Q9C030 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM6Q9C030 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM6Q9C030 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM6Q9C030 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM6Q9C030 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM6Q9C030 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM6Q9C030 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM6Q9C030 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM6Q9C030 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM6Q9C030 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM6Q9C030 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM6Q9C030 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM6Q9C030 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM6Q9C030 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM6Q9C030 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM6Q9C030 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM6Q9C030 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM6Q9C030 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM6Q9C030 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM6Q9C030 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM6Q9C030 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM6Q9C030 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM6Q9C030 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM6Q9C030 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM6Q9C030 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM6Q9C030 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM6Q9C030 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM6Q9C030 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM6Q9C030 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM6Q9C030 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM6Q9C030 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM6Q9C030 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM6Q9C030 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM6Q9C030 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM6Q9C030 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM6Q9C030 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM6Q9C030 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM6Q9C030 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM6Q9C030 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms