Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZJ0

CRNKL1, Crooked neck-like protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRNKL1Q9BZJ0 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CRNKL1Q9BZJ0 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CRNKL1Q9BZJ0 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CRNKL1Q9BZJ0 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CRNKL1Q9BZJ0 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CRNKL1Q9BZJ0 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CRNKL1Q9BZJ0 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CRNKL1Q9BZJ0 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CRNKL1Q9BZJ0 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CRNKL1Q9BZJ0 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CRNKL1Q9BZJ0 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CRNKL1Q9BZJ0 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CRNKL1Q9BZJ0 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
CRNKL1Q9BZJ0 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CRNKL1Q9BZJ0 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CRNKL1Q9BZJ0 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CRNKL1Q9BZJ0 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
CRNKL1Q9BZJ0 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
CRNKL1Q9BZJ0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CRNKL1Q9BZJ0 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CRNKL1Q9BZJ0 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CRNKL1Q9BZJ0 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CRNKL1Q9BZJ0 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CRNKL1Q9BZJ0 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CRNKL1Q9BZJ0 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CRNKL1Q9BZJ0 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CRNKL1Q9BZJ0 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CRNKL1Q9BZJ0 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CRNKL1Q9BZJ0 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CRNKL1Q9BZJ0 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CRNKL1Q9BZJ0 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CRNKL1Q9BZJ0 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CRNKL1Q9BZJ0 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CRNKL1Q9BZJ0 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CRNKL1Q9BZJ0 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CRNKL1Q9BZJ0 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CRNKL1Q9BZJ0 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CRNKL1Q9BZJ0 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CRNKL1Q9BZJ0 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CRNKL1Q9BZJ0 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CRNKL1Q9BZJ0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CRNKL1Q9BZJ0 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CRNKL1Q9BZJ0 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CRNKL1Q9BZJ0 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CRNKL1Q9BZJ0 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CRNKL1Q9BZJ0 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CRNKL1Q9BZJ0 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CRNKL1Q9BZJ0 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CRNKL1Q9BZJ0 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CRNKL1Q9BZJ0 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CRNKL1Q9BZJ0 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CRNKL1Q9BZJ0 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CRNKL1Q9BZJ0 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CRNKL1Q9BZJ0 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CRNKL1Q9BZJ0 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CRNKL1Q9BZJ0 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CRNKL1Q9BZJ0 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CRNKL1Q9BZJ0 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CRNKL1Q9BZJ0 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CRNKL1Q9BZJ0 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CRNKL1Q9BZJ0 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CRNKL1Q9BZJ0 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CRNKL1Q9BZJ0 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CRNKL1Q9BZJ0 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CRNKL1Q9BZJ0 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CRNKL1Q9BZJ0 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CRNKL1Q9BZJ0 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CRNKL1Q9BZJ0 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CRNKL1Q9BZJ0 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CRNKL1Q9BZJ0 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CRNKL1Q9BZJ0 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CRNKL1Q9BZJ0 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CRNKL1Q9BZJ0 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CRNKL1Q9BZJ0 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CRNKL1Q9BZJ0 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CRNKL1Q9BZJ0 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CRNKL1Q9BZJ0 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CRNKL1Q9BZJ0 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CRNKL1Q9BZJ0 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CRNKL1Q9BZJ0 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
CRNKL1Q9BZJ0 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CRNKL1Q9BZJ0 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CRNKL1Q9BZJ0 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CRNKL1Q9BZJ0 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CRNKL1Q9BZJ0 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CRNKL1Q9BZJ0 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CRNKL1Q9BZJ0 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CRNKL1Q9BZJ0 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CRNKL1Q9BZJ0 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CRNKL1Q9BZJ0 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CRNKL1Q9BZJ0 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CRNKL1Q9BZJ0 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CRNKL1Q9BZJ0 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CRNKL1Q9BZJ0 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CRNKL1Q9BZJ0 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CRNKL1Q9BZJ0 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CRNKL1Q9BZJ0 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CRNKL1Q9BZJ0 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CRNKL1Q9BZJ0 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CRNKL1Q9BZJ0 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms