Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE2

PUS3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUS3Q9BZE2 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PUS3Q9BZE2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PUS3Q9BZE2 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PUS3Q9BZE2 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PUS3Q9BZE2 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PUS3Q9BZE2 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PUS3Q9BZE2 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
PUS3Q9BZE2 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PUS3Q9BZE2 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PUS3Q9BZE2 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PUS3Q9BZE2 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PUS3Q9BZE2 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PUS3Q9BZE2 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PUS3Q9BZE2 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PUS3Q9BZE2 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PUS3Q9BZE2 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PUS3Q9BZE2 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PUS3Q9BZE2 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PUS3Q9BZE2 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PUS3Q9BZE2 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PUS3Q9BZE2 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
PUS3Q9BZE2 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
PUS3Q9BZE2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PUS3Q9BZE2 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PUS3Q9BZE2 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PUS3Q9BZE2 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PUS3Q9BZE2 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PUS3Q9BZE2 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PUS3Q9BZE2 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PUS3Q9BZE2 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
PUS3Q9BZE2 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PUS3Q9BZE2 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PUS3Q9BZE2 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PUS3Q9BZE2 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PUS3Q9BZE2 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PUS3Q9BZE2 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
PUS3Q9BZE2 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PUS3Q9BZE2 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PUS3Q9BZE2 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PUS3Q9BZE2 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
PUS3Q9BZE2 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PUS3Q9BZE2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PUS3Q9BZE2 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
PUS3Q9BZE2 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PUS3Q9BZE2 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PUS3Q9BZE2 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PUS3Q9BZE2 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PUS3Q9BZE2 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PUS3Q9BZE2 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PUS3Q9BZE2 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
PUS3Q9BZE2 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PUS3Q9BZE2 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
PUS3Q9BZE2 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PUS3Q9BZE2 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PUS3Q9BZE2 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PUS3Q9BZE2 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PUS3Q9BZE2 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PUS3Q9BZE2 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PUS3Q9BZE2 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PUS3Q9BZE2 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PUS3Q9BZE2 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PUS3Q9BZE2 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
PUS3Q9BZE2 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
PUS3Q9BZE2 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PUS3Q9BZE2 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PUS3Q9BZE2 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PUS3Q9BZE2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PUS3Q9BZE2 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PUS3Q9BZE2 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PUS3Q9BZE2 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PUS3Q9BZE2 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PUS3Q9BZE2 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PUS3Q9BZE2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PUS3Q9BZE2 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PUS3Q9BZE2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PUS3Q9BZE2 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PUS3Q9BZE2 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PUS3Q9BZE2 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PUS3Q9BZE2 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
PUS3Q9BZE2 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PUS3Q9BZE2 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PUS3Q9BZE2 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PUS3Q9BZE2 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PUS3Q9BZE2 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PUS3Q9BZE2 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PUS3Q9BZE2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PUS3Q9BZE2 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
PUS3Q9BZE2 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PUS3Q9BZE2 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
PUS3Q9BZE2 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
PUS3Q9BZE2 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PUS3Q9BZE2 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PUS3Q9BZE2 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PUS3Q9BZE2 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PUS3Q9BZE2 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PUS3Q9BZE2 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PUS3Q9BZE2 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PUS3Q9BZE2 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
PUS3Q9BZE2 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PUS3Q9BZE2 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms