Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM55Q9BYV6 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM55Q9BYV6 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM55Q9BYV6 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM55Q9BYV6 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM55Q9BYV6 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM55Q9BYV6 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM55Q9BYV6 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM55Q9BYV6 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM55Q9BYV6 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM55Q9BYV6 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM55Q9BYV6 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM55Q9BYV6 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM55Q9BYV6 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM55Q9BYV6 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM55Q9BYV6 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM55Q9BYV6 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM55Q9BYV6 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM55Q9BYV6 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM55Q9BYV6 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM55Q9BYV6 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM55Q9BYV6 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM55Q9BYV6 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM55Q9BYV6 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM55Q9BYV6 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM55Q9BYV6 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM55Q9BYV6 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM55Q9BYV6 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM55Q9BYV6 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM55Q9BYV6 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM55Q9BYV6 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM55Q9BYV6 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM55Q9BYV6 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM55Q9BYV6 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM55Q9BYV6 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM55Q9BYV6 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM55Q9BYV6 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM55Q9BYV6 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM55Q9BYV6 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM55Q9BYV6 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM55Q9BYV6 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM55Q9BYV6 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM55Q9BYV6 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM55Q9BYV6 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM55Q9BYV6 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM55Q9BYV6 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM55Q9BYV6 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM55Q9BYV6 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM55Q9BYV6 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM55Q9BYV6 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM55Q9BYV6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM55Q9BYV6 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM55Q9BYV6 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM55Q9BYV6 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM55Q9BYV6 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TRIM55Q9BYV6 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM55Q9BYV6 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM55Q9BYV6 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM55Q9BYV6 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM55Q9BYV6 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM55Q9BYV6 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM55Q9BYV6 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM55Q9BYV6 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM55Q9BYV6 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM55Q9BYV6 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM55Q9BYV6 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM55Q9BYV6 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM55Q9BYV6 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM55Q9BYV6 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM55Q9BYV6 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM55Q9BYV6 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM55Q9BYV6 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM55Q9BYV6 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM55Q9BYV6 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM55Q9BYV6 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM55Q9BYV6 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM55Q9BYV6 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM55Q9BYV6 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM55Q9BYV6 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM55Q9BYV6 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM55Q9BYV6 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM55Q9BYV6 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM55Q9BYV6 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM55Q9BYV6 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM55Q9BYV6 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM55Q9BYV6 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM55Q9BYV6 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM55Q9BYV6 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM55Q9BYV6 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM55Q9BYV6 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM55Q9BYV6 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM55Q9BYV6 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM55Q9BYV6 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM55Q9BYV6 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM55Q9BYV6 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM55Q9BYV6 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM55Q9BYV6 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM55Q9BYV6 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM55Q9BYV6 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM55Q9BYV6 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms