Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR8

KRTAP3-1, Keratin-associated protein 3-1, humanhuman

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP3-1Q9BYR8 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
KRTAP3-1Q9BYR8 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
KRTAP3-1Q9BYR8 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
KRTAP3-1Q9BYR8 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
KRTAP3-1Q9BYR8 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
KRTAP3-1Q9BYR8 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
KRTAP3-1Q9BYR8 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
KRTAP3-1Q9BYR8 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
KRTAP3-1Q9BYR8 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
KRTAP3-1Q9BYR8 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
KRTAP3-1Q9BYR8 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
KRTAP3-1Q9BYR8 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
KRTAP3-1Q9BYR8 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
KRTAP3-1Q9BYR8 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
KRTAP3-1Q9BYR8 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
KRTAP3-1Q9BYR8 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
KRTAP3-1Q9BYR8 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
KRTAP3-1Q9BYR8 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
KRTAP3-1Q9BYR8 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
KRTAP3-1Q9BYR8 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
KRTAP3-1Q9BYR8 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
KRTAP3-1Q9BYR8 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
KRTAP3-1Q9BYR8 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
KRTAP3-1Q9BYR8 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
KRTAP3-1Q9BYR8 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
KRTAP3-1Q9BYR8 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
KRTAP3-1Q9BYR8 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
KRTAP3-1Q9BYR8 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
KRTAP3-1Q9BYR8 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
KRTAP3-1Q9BYR8 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
KRTAP3-1Q9BYR8 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
KRTAP3-1Q9BYR8 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
KRTAP3-1Q9BYR8 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
KRTAP3-1Q9BYR8 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
KRTAP3-1Q9BYR8 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
KRTAP3-1Q9BYR8 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
KRTAP3-1Q9BYR8 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
KRTAP3-1Q9BYR8 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
KRTAP3-1Q9BYR8 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
KRTAP3-1Q9BYR8 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
KRTAP3-1Q9BYR8 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
KRTAP3-1Q9BYR8 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
KRTAP3-1Q9BYR8 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
KRTAP3-1Q9BYR8 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
KRTAP3-1Q9BYR8 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
KRTAP3-1Q9BYR8 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
KRTAP3-1Q9BYR8 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
KRTAP3-1Q9BYR8 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
KRTAP3-1Q9BYR8 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
KRTAP3-1Q9BYR8 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
KRTAP3-1Q9BYR8 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
KRTAP3-1Q9BYR8 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
KRTAP3-1Q9BYR8 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
KRTAP3-1Q9BYR8 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
KRTAP3-1Q9BYR8 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
KRTAP3-1Q9BYR8 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
KRTAP3-1Q9BYR8 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
KRTAP3-1Q9BYR8 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
KRTAP3-1Q9BYR8 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
KRTAP3-1Q9BYR8 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
KRTAP3-1Q9BYR8 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
KRTAP3-1Q9BYR8 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
KRTAP3-1Q9BYR8 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
KRTAP3-1Q9BYR8 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
KRTAP3-1Q9BYR8 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
KRTAP3-1Q9BYR8 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
KRTAP3-1Q9BYR8 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
KRTAP3-1Q9BYR8 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
KRTAP3-1Q9BYR8 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
KRTAP3-1Q9BYR8 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
KRTAP3-1Q9BYR8 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
KRTAP3-1Q9BYR8 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
KRTAP3-1Q9BYR8 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
KRTAP3-1Q9BYR8 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
KRTAP3-1Q9BYR8 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
KRTAP3-1Q9BYR8 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
KRTAP3-1Q9BYR8 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
KRTAP3-1Q9BYR8 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
KRTAP3-1Q9BYR8 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
KRTAP3-1Q9BYR8 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
KRTAP3-1Q9BYR8 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
KRTAP3-1Q9BYR8 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
KRTAP3-1Q9BYR8 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
KRTAP3-1Q9BYR8 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
KRTAP3-1Q9BYR8 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
KRTAP3-1Q9BYR8 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
KRTAP3-1Q9BYR8 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
KRTAP3-1Q9BYR8 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
KRTAP3-1Q9BYR8 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
KRTAP3-1Q9BYR8 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
KRTAP3-1Q9BYR8 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
KRTAP3-1Q9BYR8 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
KRTAP3-1Q9BYR8 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
KRTAP3-1Q9BYR8 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
KRTAP3-1Q9BYR8 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
KRTAP3-1Q9BYR8 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
KRTAP3-1Q9BYR8 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
KRTAP3-1Q9BYR8 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
KRTAP3-1Q9BYR8 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
KRTAP3-1Q9BYR8 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms