Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NIFKQ9BYG3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NIFKQ9BYG3 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NIFKQ9BYG3 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NIFKQ9BYG3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NIFKQ9BYG3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NIFKQ9BYG3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NIFKQ9BYG3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NIFKQ9BYG3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NIFKQ9BYG3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NIFKQ9BYG3 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NIFKQ9BYG3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NIFKQ9BYG3 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NIFKQ9BYG3 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
NIFKQ9BYG3 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NIFKQ9BYG3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NIFKQ9BYG3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NIFKQ9BYG3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NIFKQ9BYG3 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NIFKQ9BYG3 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NIFKQ9BYG3 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NIFKQ9BYG3 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NIFKQ9BYG3 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
NIFKQ9BYG3 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
NIFKQ9BYG3 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NIFKQ9BYG3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NIFKQ9BYG3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NIFKQ9BYG3 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
NIFKQ9BYG3 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
NIFKQ9BYG3 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NIFKQ9BYG3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NIFKQ9BYG3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NIFKQ9BYG3 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NIFKQ9BYG3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NIFKQ9BYG3 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NIFKQ9BYG3 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NIFKQ9BYG3 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NIFKQ9BYG3 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NIFKQ9BYG3 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
NIFKQ9BYG3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NIFKQ9BYG3 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NIFKQ9BYG3 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
NIFKQ9BYG3 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
NIFKQ9BYG3 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
NIFKQ9BYG3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NIFKQ9BYG3 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NIFKQ9BYG3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NIFKQ9BYG3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NIFKQ9BYG3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NIFKQ9BYG3 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NIFKQ9BYG3 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NIFKQ9BYG3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NIFKQ9BYG3 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NIFKQ9BYG3 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NIFKQ9BYG3 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
NIFKQ9BYG3 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NIFKQ9BYG3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
NIFKQ9BYG3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NIFKQ9BYG3 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NIFKQ9BYG3 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NIFKQ9BYG3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NIFKQ9BYG3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NIFKQ9BYG3 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NIFKQ9BYG3 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NIFKQ9BYG3 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NIFKQ9BYG3 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NIFKQ9BYG3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NIFKQ9BYG3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NIFKQ9BYG3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NIFKQ9BYG3 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NIFKQ9BYG3 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NIFKQ9BYG3 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NIFKQ9BYG3 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
NIFKQ9BYG3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
NIFKQ9BYG3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NIFKQ9BYG3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NIFKQ9BYG3 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NIFKQ9BYG3 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NIFKQ9BYG3 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NIFKQ9BYG3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NIFKQ9BYG3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NIFKQ9BYG3 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NIFKQ9BYG3 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NIFKQ9BYG3 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NIFKQ9BYG3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NIFKQ9BYG3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NIFKQ9BYG3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NIFKQ9BYG3 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
NIFKQ9BYG3 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
NIFKQ9BYG3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NIFKQ9BYG3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NIFKQ9BYG3 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NIFKQ9BYG3 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NIFKQ9BYG3 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
NIFKQ9BYG3 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NIFKQ9BYG3 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NIFKQ9BYG3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NIFKQ9BYG3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NIFKQ9BYG3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NIFKQ9BYG3 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms