Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
PCGF6Q9BYE7 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
PCGF6Q9BYE7 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
PCGF6Q9BYE7 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
PCGF6Q9BYE7 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
PCGF6Q9BYE7 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
PCGF6Q9BYE7 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
PCGF6Q9BYE7 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
PCGF6Q9BYE7 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
PCGF6Q9BYE7 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
PCGF6Q9BYE7 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
PCGF6Q9BYE7 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
PCGF6Q9BYE7 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
PCGF6Q9BYE7 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
PCGF6Q9BYE7 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC35.13■■■■□ 3.21
PCGF6Q9BYE7 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
PCGF6Q9BYE7 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
PCGF6Q9BYE7 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
PCGF6Q9BYE7 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
PCGF6Q9BYE7 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
PCGF6Q9BYE7 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
PCGF6Q9BYE7 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
PCGF6Q9BYE7 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
PCGF6Q9BYE7 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC35.11■■■■□ 3.21
PCGF6Q9BYE7 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
PCGF6Q9BYE7 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
PCGF6Q9BYE7 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
PCGF6Q9BYE7 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
PCGF6Q9BYE7 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
PCGF6Q9BYE7 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
PCGF6Q9BYE7 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC35.1■■■■□ 3.21
PCGF6Q9BYE7 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
PCGF6Q9BYE7 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC35.1■■■■□ 3.21
PCGF6Q9BYE7 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
PCGF6Q9BYE7 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
PCGF6Q9BYE7 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
PCGF6Q9BYE7 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
PCGF6Q9BYE7 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
PCGF6Q9BYE7 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
PCGF6Q9BYE7 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
PCGF6Q9BYE7 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
PCGF6Q9BYE7 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
PCGF6Q9BYE7 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
PCGF6Q9BYE7 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
PCGF6Q9BYE7 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
PCGF6Q9BYE7 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
PCGF6Q9BYE7 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
PCGF6Q9BYE7 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
PCGF6Q9BYE7 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
PCGF6Q9BYE7 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
PCGF6Q9BYE7 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
PCGF6Q9BYE7 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
PCGF6Q9BYE7 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
PCGF6Q9BYE7 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
PCGF6Q9BYE7 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
PCGF6Q9BYE7 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
PCGF6Q9BYE7 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
PCGF6Q9BYE7 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
PCGF6Q9BYE7 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
PCGF6Q9BYE7 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
PCGF6Q9BYE7 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
PCGF6Q9BYE7 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
PCGF6Q9BYE7 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
PCGF6Q9BYE7 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
PCGF6Q9BYE7 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
PCGF6Q9BYE7 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
PCGF6Q9BYE7 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
PCGF6Q9BYE7 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
PCGF6Q9BYE7 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
PCGF6Q9BYE7 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
PCGF6Q9BYE7 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
PCGF6Q9BYE7 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
PCGF6Q9BYE7 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
PCGF6Q9BYE7 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.04■■■■□ 3.2
PCGF6Q9BYE7 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
PCGF6Q9BYE7 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
PCGF6Q9BYE7 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
PCGF6Q9BYE7 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC35.04■■■■□ 3.2
PCGF6Q9BYE7 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
PCGF6Q9BYE7 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
PCGF6Q9BYE7 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
PCGF6Q9BYE7 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
PCGF6Q9BYE7 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
PCGF6Q9BYE7 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
PCGF6Q9BYE7 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
PCGF6Q9BYE7 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
PCGF6Q9BYE7 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
PCGF6Q9BYE7 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
PCGF6Q9BYE7 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
PCGF6Q9BYE7 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
PCGF6Q9BYE7 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
PCGF6Q9BYE7 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC35.02■■■■□ 3.2
PCGF6Q9BYE7 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
PCGF6Q9BYE7 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
PCGF6Q9BYE7 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
PCGF6Q9BYE7 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
PCGF6Q9BYE7 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
PCGF6Q9BYE7 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
PCGF6Q9BYE7 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.2
PCGF6Q9BYE7 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms