Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms