Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
VN1R3Q9BXE9 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VN1R3Q9BXE9 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VN1R3Q9BXE9 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VN1R3Q9BXE9 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VN1R3Q9BXE9 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VN1R3Q9BXE9 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VN1R3Q9BXE9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VN1R3Q9BXE9 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VN1R3Q9BXE9 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VN1R3Q9BXE9 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VN1R3Q9BXE9 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VN1R3Q9BXE9 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
VN1R3Q9BXE9 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VN1R3Q9BXE9 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VN1R3Q9BXE9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VN1R3Q9BXE9 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VN1R3Q9BXE9 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VN1R3Q9BXE9 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VN1R3Q9BXE9 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
VN1R3Q9BXE9 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
VN1R3Q9BXE9 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VN1R3Q9BXE9 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VN1R3Q9BXE9 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
VN1R3Q9BXE9 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VN1R3Q9BXE9 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
VN1R3Q9BXE9 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VN1R3Q9BXE9 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
VN1R3Q9BXE9 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VN1R3Q9BXE9 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VN1R3Q9BXE9 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VN1R3Q9BXE9 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
VN1R3Q9BXE9 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VN1R3Q9BXE9 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
VN1R3Q9BXE9 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
VN1R3Q9BXE9 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
VN1R3Q9BXE9 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VN1R3Q9BXE9 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
VN1R3Q9BXE9 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VN1R3Q9BXE9 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VN1R3Q9BXE9 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VN1R3Q9BXE9 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VN1R3Q9BXE9 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VN1R3Q9BXE9 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VN1R3Q9BXE9 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VN1R3Q9BXE9 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VN1R3Q9BXE9 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VN1R3Q9BXE9 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
VN1R3Q9BXE9 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VN1R3Q9BXE9 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VN1R3Q9BXE9 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VN1R3Q9BXE9 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VN1R3Q9BXE9 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VN1R3Q9BXE9 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VN1R3Q9BXE9 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VN1R3Q9BXE9 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VN1R3Q9BXE9 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VN1R3Q9BXE9 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
VN1R3Q9BXE9 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VN1R3Q9BXE9 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VN1R3Q9BXE9 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VN1R3Q9BXE9 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
VN1R3Q9BXE9 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
VN1R3Q9BXE9 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
VN1R3Q9BXE9 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
VN1R3Q9BXE9 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
VN1R3Q9BXE9 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VN1R3Q9BXE9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
VN1R3Q9BXE9 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
VN1R3Q9BXE9 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VN1R3Q9BXE9 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VN1R3Q9BXE9 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
VN1R3Q9BXE9 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VN1R3Q9BXE9 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VN1R3Q9BXE9 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
VN1R3Q9BXE9 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
VN1R3Q9BXE9 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
VN1R3Q9BXE9 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
VN1R3Q9BXE9 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VN1R3Q9BXE9 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VN1R3Q9BXE9 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
VN1R3Q9BXE9 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
VN1R3Q9BXE9 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
VN1R3Q9BXE9 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
VN1R3Q9BXE9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
VN1R3Q9BXE9 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
VN1R3Q9BXE9 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
VN1R3Q9BXE9 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VN1R3Q9BXE9 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VN1R3Q9BXE9 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VN1R3Q9BXE9 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VN1R3Q9BXE9 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
VN1R3Q9BXE9 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VN1R3Q9BXE9 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
VN1R3Q9BXE9 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
VN1R3Q9BXE9 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
VN1R3Q9BXE9 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
VN1R3Q9BXE9 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VN1R3Q9BXE9 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
VN1R3Q9BXE9 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms